RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580799.2

GGA3-210, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene GGA3, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-210ENST00000580799 AKR1C3P42330 323 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-210ENST00000580799 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
GGA3-210ENST00000580799 RBX1P62877 108 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-210ENST00000580799 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
GGA3-210ENST00000580799 Q5BKY6 102 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-210ENST00000580799 CST9LP1Q5W188 147 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-210ENST00000580799 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-210ENST00000580799 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-210ENST00000580799 STOML3Q8TAV4 291 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-210ENST00000580799 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
GGA3-210ENST00000580799 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 F5H697 171 aa6.58□□□□□ -1.36
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GGA3-210ENST00000580799 SNAI2O43623 268 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 OR5AL1P0C617 328 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 RNF185Q96GF1 192 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 DERL1Q9BUN8 251 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 P01737 135 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 SMIM17P0DL12 118 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 REG3AQ06141 175 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 IQCJQ1A5X6 159 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 AP1S3Q96PC3 154 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.56□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.56□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.56□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 hDV102S1A0JD36 115 aa6.56□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 GZMBP10144 247 aa6.56□□□□□ -1.36
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GGA3-210ENST00000580799 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.56□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.56□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.56□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 H7C1H1 209 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 PAGE4O60829 102 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 BAGE2Q86Y30 109 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 DPH3Q96FX2 82 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.54□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.54□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 A0A1B0GUV1 79 aa6.54□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 PFDN1O60925 122 aa6.54□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 A0A087WYN8 130 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 M0QY20 66 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 TMEM243Q9BU79 118 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-210ENST00000580799 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.53□□□□□ -1.36
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GGA3-210ENST00000580799 ARPC5O15511 151 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 SSTP61278 116 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 TMUB2Q71RG4 321 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 C7orf33Q8WU49 177 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 SLPIP03973 132 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 MGPP08493 103 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 CHTF8P0CG12 524 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 WDR73Q6P4I2 378 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 RASL11AQ6T310 242 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 G3V3Q6 166 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 PHOX2AO14813 284 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 UBE2L6O14933 153 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 IGLC6P0CF74 106 aa6.5□□□□□ -1.37
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GGA3-210ENST00000580799 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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GGA3-210ENST00000580799 CFAP161Q6P656 301 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 NIT2Q9NQR4 276 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 F2Z2F3 143 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 TRGC1P0CF51 173 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 SULT1A2P50226 295 aa6.49□□□□□ -1.37
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GGA3-210ENST00000580799 ZNF345Q14585 488 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 C15orf56Q8N910 161 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 LINC01600Q96MT4 127 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 TPPP3Q9BW30 176 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.49□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 A0A1B0GV50 99 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 XKRY2A2RUG3 117 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
GGA3-210ENST00000580799 AMTP48728 403 aa6.48□□□□□ -1.37
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