RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 GGTLC3B5MD39 225 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 MT1HL1P0DM35 61 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 FGF7P21781 194 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 PMVKQ15126 192 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 PYDC2Q56P42 97 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 Q6AWC8 147 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM126AQ9H061 195 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 SH3BGRL3Q9H299 93 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1W2PRE2 83 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 FAM231BA6NCW3 169 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 TAAR5O14804 337 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 GNRH2O43555 120 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 CST7O76096 145 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 CSN1S1P47710 185 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRM-210ENST00000578916 C4orf26Q17RF5 130 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 GAGE2EQ4V326 116 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 CST9LQ9H4G1 147 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 RBAKDNA6NC62 111 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 ASIPP42127 132 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 C1orf195Q5TG92 126 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00299Q6ZSB3 139 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 DEDD2Q8WXF8 326 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 TNXBP22105 4242 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRM-210ENST00000578916 GCGP01275 180 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 S100A2P29034 98 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 FAM162BQ5T6X4 162 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 Q6ZRU5 148 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRM-210ENST00000578916 GATD1Q8NB37 220 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 ASB13Q8WXK3 278 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 MED9Q9NWA0 146 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 LENEPQ9Y5L5 61 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM218A2RU14 115 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 SEC11BP0C7V7 166 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 ESDP10768 282 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF876PQ49A33 203 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 C14orf177Q52M58 125 aa5.91□□□□□ -1.46
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PTPRM-210ENST00000578916 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.91□□□□□ -1.46
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PTPRM-210ENST00000578916 FXYD5Q96DB9 178 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 PHYHIPLQ96FC7 376 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 C2orf50Q96LR7 162 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 PAXXQ9BUH6 204 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 A0A087WX48 190 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 GAGE12JA6NER3 117 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 NDUFB6O95139 128 aa5.9□□□□□ -1.46
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PTPRM-210ENST00000578916 IL7P13232 177 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 GAGE4Q13068 117 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 TMED6Q8WW62 240 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 HIST1H2BAQ96A08 127 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 KCNS1Q96KK3 526 aa5.9□□□□□ -1.46
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PTPRM-210ENST00000578916 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
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PTPRM-210ENST00000578916 INPP1P49441 399 aa5.89□□□□□ -1.47
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PTPRM-210ENST00000578916 HBG2P69892 147 aa5.89□□□□□ -1.47
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PTPRM-210ENST00000578916 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.89□□□□□ -1.47
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PTPRM-210ENST00000578916 ERG28Q9UKR5 140 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0D9SG52 128 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 NAP1L6A6NFF2 107 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 CCL25O15444 150 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 ELOBQ15370 118 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-210ENST00000578916 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa5.88□□□□□ -1.47
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