RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.8□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.8□□□□□ -0.84
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CMTM3-215ENST00000568477 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.8□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.8□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.8□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.8□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 A8MWV9 139 aa9.79□□□□□ -0.84
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CMTM3-215ENST00000568477 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.79□□□□□ -0.84
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CMTM3-215ENST00000568477 HBBP68871 147 aa9.73□□□□□ -0.85
CMTM3-215ENST00000568477 RIGQ13278 110 aa9.73□□□□□ -0.85
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CMTM3-215ENST00000568477 SCRT2Q9NQ03 307 aa9.73□□□□□ -0.85
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CMTM3-215ENST00000568477 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.72□□□□□ -0.85
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CMTM3-215ENST00000568477 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
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CMTM3-215ENST00000568477 IGLC6P0CF74 106 aa9.71□□□□□ -0.86
CMTM3-215ENST00000568477 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.71□□□□□ -0.86
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CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.71□□□□□ -0.86
CMTM3-215ENST00000568477 Q9HAA7 133 aa9.71□□□□□ -0.86
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