RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561040.1

MEIS3-209, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEIS3, Length 1,809 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-209ENST00000561040 F5H697 171 aa12.02□□□□□ -0.49
MEIS3-209ENST00000561040 ZNF876PQ49A33 203 aa12.02□□□□□ -0.49
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MEIS3-209ENST00000561040 C2orf91Q6ZV80 131 aa12.02□□□□□ -0.49
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MEIS3-209ENST00000561040 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
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MEIS3-209ENST00000561040 C18orf15Q96N68 181 aa11.98□□□□□ -0.49
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MEIS3-209ENST00000561040 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
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MEIS3-209ENST00000561040 M0QY20 66 aa11.96□□□□□ -0.49
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MEIS3-209ENST00000561040 H3BUT2 72 aa11.95□□□□□ -0.5
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MEIS3-209ENST00000561040 TIMM17AQ99595 171 aa11.87□□□□□ -0.51
MEIS3-209ENST00000561040 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa11.87□□□□□ -0.51
MEIS3-209ENST00000561040 CUBNO60494 3623 aa11.86□□□□□ -0.51
MEIS3-209ENST00000561040 C16orf74Q96GX8 76 aa11.86□□□□□ -0.51
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MEIS3-209ENST00000561040 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
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