RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 ERVS71-1P61550 626 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 NPC2P61916 151 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 KLK9Q2XQG4 91 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 PIGYQ3MUY2 71 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 HSD17B12Q53GQ0 312 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 DCUN1D2Q6PH85 259 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TMED4Q7Z7H5 227 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SNX29P2Q8IUI4 249 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SMIM20Q8N5G0 67 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SLC35B3Q9H1N7 401 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 NDUFAF1Q9Y375 327 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 MYH8P13535 1937 aa-0.47□□□□□ -2.48
FAM227B-211ENST00000560557 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-0.47□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF609O15014 1411 aa-0.47□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 A2MP01023 1474 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 ERCC6L2Q5T890 1561 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 YPEL1O60688 119 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 SMIM24O75264 130 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 TCRAP04437 139 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 COX6B1P14854 86 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 SPRR1BP22528 89 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 HSD11B1P28845 292 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 HAMPP81172 84 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 CFAP126Q5VTH2 177 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 Q5VV11 94 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 BAGE3Q86Y29 109 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 WFDC6Q9BQY6 131 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 PARVGQ9HBI0 331 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 CALML5Q9NZT1 146 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 MED31Q9Y3C7 131 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 HTTP42858 3142 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 KNL1Q8NG31 2342 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 ARAP1Q96P48 1450 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 WDR7Q9Y4E6 1490 aa-0.48□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 IFT172Q9UG01 1749 aa-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 A6NIN4 97 aa-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 E7EQ34 232 aa-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 H0YJX3 145 aa-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 J3KT08 172 aa-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 J3QLW9 94 aa-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 SERPINB1P30740 379 aa-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 HRCT1Q6UXD1 115 aa-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 STX12Q86Y82 276 aa-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 STOML2Q9UJZ1 356 aa-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 MYH13Q9UKX3 1938 aa-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 WDR97A6NE52 1622 aa-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 LAMC1P11047 1609 aa-0.49□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 SPRR2EP22531 72 aa-0.5□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.5□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM91Q6ZNR0 172 aa-0.5□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa-0.5□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 THEM6Q8WUY1 208 aa-0.5□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 SMIM4Q8WVI0 70 aa-0.5□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 MAFIPQ8WZ33 124 aa-0.5□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 RPRMQ9NS64 109 aa-0.5□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 RYR2Q92736 4967 aa-0.5□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 AKAP9Q99996 3911 aa-0.5□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 AKAP13Q12802 2813 aa-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 A0A1W2PRE2 83 aa-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 I3L2K1 104 aa-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 LRP6O75581 1613 aa-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 DPM2O94777 84 aa-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 IFNA17P01571 189 aa-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 PAEPP09466 180 aa-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 HLA-DRB4P13762 266 aa-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 PTPRMP28827 1452 aa-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 CLLU1Q5K131 121 aa-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 TRIQKQ629K1 86 aa-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM35BQ8NCS4 154 aa-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB105AQ8NG35 78 aa-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC115Q96NT0 180 aa-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 ATPIF1Q9UII2 106 aa-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 MED23Q9ULK4 1368 aa-0.51□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms