RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560521.5

RABGGTA-217, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 CYTL1Q9NRR1 136 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 PRR34Q9NV39 138 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 PSG8Q9UQ74 426 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 RHODO00212 210 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 LCE2BO14633 110 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 TAS2R45P59539 299 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 PEA15Q15121 130 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 SMUG1Q53HV7 270 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 CLPSL2Q6UWE3 100 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 SVBPQ8N300 66 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 IL36BQ9NZH7 164 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 IFNA1P01562 189 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 TCRAP04437 139 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 COX6A2Q02221 97 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 OR10G8Q8NGN5 311 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 SFRP2Q96HF1 295 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 SEC11CQ9BY50 192 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 H3BVH4 76 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 ARMS2P0C7Q2 107 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 MAJINQ3KP22 176 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 PRNTQ86SH4 94 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A0U1RQV1 116 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 SNAPINO95295 136 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 RBX1P62877 108 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 DNLZQ5SXM8 178 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 PQLC2Q6ZP29 291 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 STPG4Q8N801 248 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 VAX2Q9UIW0 290 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTA-217ENST00000560521 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 H7C1H1 209 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 PKIAP61925 76 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 REG3AQ06141 175 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 GAGE6Q13070 117 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 C10orf91Q5T1B1 145 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 C5orf17Q8NAS9 161 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM218A2RU14 115 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 GRIFINA4D1Z8 144 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 B4DEV8 164 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 K7EQM0 130 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 ATP6V0CP27449 155 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 CRIP1P50238 77 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 MBD3L1Q8WWY6 194 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A1W2PPV4 95 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 M0R381 172 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 PRR27Q6MZM9 219 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 BTF3L4Q96K17 158 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 TCEAL7Q9BRU2 100 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 MANBALQ9NQG1 85 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 EPDR1Q9UM22 224 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A096LNI7 61 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 TRAV34A0A0B4J273 112 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM231BA6NCW3 169 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 M0R036 132 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 P01737 135 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 ARL14EPLP0DKL9 152 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 RAB4BP61018 213 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 RHEBQ15382 184 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 Q6ZRP5 223 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 C15orf56Q8N910 161 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTA-217ENST00000560521 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.48□□□□□ -1.53
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