RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 APCP25054 2843 aa14.73□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa14.73□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa14.73□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 FSHBP01225 129 aa14.73□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 RIPPLY3P57055 190 aa14.72□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 TSPEAR-AS2P59090 65 aa14.72□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.72□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 P0DMU3 169 aa14.71□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM231AP0DMU4 169 aa14.71□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM231CP0DMU5 169 aa14.71□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 DEFB131AP59861 70 aa14.71□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM170BQ5T4T1 132 aa14.71□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 TIMM17AQ99595 171 aa14.71□□□□□ -0.05
AFG3L1P-217ENST00000557444 MTURNQ8N3F0 131 aa14.71□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 WNK1Q9H4A3 2382 aa14.71□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 H3BMG7 143 aa14.7□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 PROK1P58294 105 aa14.7□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM141Q96I45 108 aa14.7□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 LINC01619G3V211 115 aa14.7□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 G3V4G9 280 aa14.7□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP14.69□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 RPL24P83731 157 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 RRN3P1Q2M238 152 aa14.68□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 ITPR3Q14573 2671 aa14.68□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC168Q8NDH2 2452 aa14.68□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 A0A1B0GWB2 263 aa14.67□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa14.67□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 WFDC2Q14508 124 aa14.67□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.67□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 SFTA2Q6UW10 78 aa14.67□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 Q9UF83 564 aa14.67□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 Q5PR19 223 aa14.66□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNF152Q8N8N0 203 aa14.66□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 HERVK_113P61574 105 aa14.66□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa14.66□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM61Q8N0U2 210 aa14.66□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 NACAE9PAV3 2078 aa14.65□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 A0A0J9YY99 117 aa14.65□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa14.65□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa14.65□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRGV11A0A075B6L2 103 aa14.65□□□□□ -0.06
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa14.64□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 LINC01549A6NIU2 74 aa14.64□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 C20orf203Q8NBC4 194 aa14.64□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 H3BMM0 161 aa14.64□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 I3L3M4 83 aa14.63□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.63□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 APOMO95445 188 aa14.63□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 RHOHQ15669 191 aa14.63□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 Q96MF0 132 aa14.63□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 AMELXQ99217 191 aa14.62□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 SH2D6Q7Z4S9 175 aa14.62□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 DEFB113Q30KQ7 82 aa14.61□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 J3QQQ9 107 aa14.61□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 UBE2D1P51668 147 aa14.61□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 Q6ZSN1 163 aa14.61□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF843Q8N446 348 aa14.61□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa14.6□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 A0A0J9YXV3 536 aa14.6□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 ETDBQ3ZM63 59 aa14.59□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 NFE4Q86UQ8 179 aa14.59□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 F8W1H4 67 aa14.58□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 TSPAN13O95857 204 aa14.58□□□□□ -0.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa14.58□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 A6NJY4 79 aa14.58□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 Q8N2B8 174 aa14.58□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 C11orf44Q8N8P7 122 aa14.58□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAP6D1Q9H9H5 199 aa14.58□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM223A0PJW6 202 aa14.57□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGHV3-30P01768 117 aa14.57□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa14.57□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM104AQ969W3 186 aa14.57□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 JMJD1CQ15652 2540 aa14.57□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 GAGE13Q4V321 117 aa14.57□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.57□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 VCX2Q9H322 139 aa14.57□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRO0461Q9UI25 63 aa14.57□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 CD28P10747 220 aa14.56□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 DYNLRB2Q8TF09 96 aa14.56□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa14.56□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARL17AQ8IVW1 177 aa14.56□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 C4orf3Q8WVX3 66 aa14.56□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 PEMTQ9UBM1 199 aa14.56□□□□□ -0.08
AFG3L1P-217ENST00000557444 A8MTW9 85 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms