RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555503.1

GPHN-208, Transcript of gephyrin, human

TSL 3

Gene GPHN, Length 655 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPHN-208	ENST00000555503	RHOH	Q15669	191 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	LELP1	Q5T871	98 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	TMUB2	Q71RG4	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	ATP5S	Q99766	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	OTOR	Q9NRC9	128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	TAS2R45	P59539	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	RAB2A	P61019	212 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503		Q6ZSA8	131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503		Q9UF83	564 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	TSPAN13	O95857	204 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	C1QB	P02746	253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	H2BFS	P57053	126 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	HSPB11	Q9Y547	144 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503		A0A1W2PPV4	95 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	GCG	P01275	180 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	CFC1	P0CG37	223 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	PRNT	Q86SH4	94 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	ENKUR	Q8TC29	256 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	WFDC1	Q9HC57	220 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GPHN-208	ENST00000555503	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	MPC2	O95563	127 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	ASAH1	Q13510	395 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503		H3BVH4	76 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	TAAR5	O14804	337 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	SSNA1	O43805	119 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	TCRA	P04437	139 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	PET100	P0DJ07	73 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	GCHFR	P30047	84 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	NIT1	Q86X76	327 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503		A8MWV9	139 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503		M0R036	132 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	ASIP	P42127	132 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	IFITM3	Q01628	133 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503		Q8N976	141 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	RMI2	Q96E14	147 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503		A0A087WWC5	75 aa		4.48	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503		A0A087WX48	190 aa		4.48	□□□□□ -1.69
GPHN-208	ENST00000555503	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.48	□□□□□ -1.69

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