RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		6.13	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	CCL24	O00175	119 aa		6.13	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		6.13	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0C4DFX4	3053 aa		6.12	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193		K7EMT4	169 aa		6.12	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	C5orf38	Q86SI9	138 aa		6.12	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	GPHB5	Q86YW7	130 aa		6.12	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	C19orf84	I3L1E1	186 aa		6.12	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	GHRH	P01286	108 aa		6.12	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	PTH2	Q96A98	100 aa		6.12	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	DAD1	P61803	113 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0J9YX75	114 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	RS1	O15537	224 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	TIMM17A	Q99595	171 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193		A6NDX4	124 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	XCL1	P47992	114 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	C20orf173	Q96LM9	149 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		6.11	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	GAS8-AS1	O95177	125 aa		6.1	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	MED14OS	P0DP75	135 aa		6.1	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	EBI3	Q14213	229 aa		6.1	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		6.1	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		6.1	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		6.1	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	TEN1	Q86WV5	123 aa		6.1	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0J9YY99	117 aa		6.09	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	SOCS3	O14543	225 aa		6.09	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193		P0DMU3	169 aa		6.09	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	FAM231A	P0DMU4	169 aa		6.09	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	FAM231C	P0DMU5	169 aa		6.09	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		6.09	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	RNF185	Q96GF1	192 aa		6.09	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		6.09	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		6.09	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		6.09	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	LINC01620	Q4KN68	170 aa		6.09	□□□□□ -1.43
NEK1-208	ENST00000512193	PRSS47	A8MTI9	375 aa		6.09	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	CDSN	Q15517	529 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	HTT	P42858	3142 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	FSTL3	O95633	263 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193		Q8N976	141 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193		G3V4G9	280 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	IFITM1	P13164	125 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZQT7	251 aa		6.08	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	FOXI1	Q12951	378 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	ESM1	Q9NQ30	184 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	ACAN	P16112	2415 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	IGHG4	P01861	327 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193		U3KQK5	164 aa		6.07	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	CRYBA4	P53673	196 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193		B5MCH6	92 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193		Q8N6K4	173 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	TM2D2	Q9BX73	214 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193		K7EQD1	137 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	HAMP	P81172	84 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	PRR9	Q5T870	116 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	CLEC2B	Q92478	149 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193		K7EQG2	157 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	GYPE	P15421	78 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZUT4	128 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	RNF152	Q8N8N0	203 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	CRLF1	O75462	422 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NEK1-208	ENST00000512193	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44

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