RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511313.5

POLR2J3-215, Transcript of RNA polymerase II subunit J3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POLR2J3, Length 4,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J3-215ENST00000511313 GNRH2O43555 120 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 PLNP26678 52 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 Q6ZTI0 123 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 C12orf57Q99622 126 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 FAM229AH3BQW9 127 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 PTTG1IPP53801 180 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 IQCJQ1A5X6 159 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 hDV102S1A0JD36 115 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 CTRLP40313 264 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 H3BQ85 93 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 JPT2Q9H910 190 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 LINC00158P58513 81 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 Q9H8V8 135 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 KLK12Q9UKR0 248 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF292O60281 2723 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 TSTD3H0UI37 97 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 M0R143 59 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 Q6ZPA2 131 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 C17orf77Q96MU5 243 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 C18orf15Q96N68 181 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 DPM2O94777 84 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 PMVKQ15126 192 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 UTF1Q5T230 341 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 TMEM238C9JI98 176 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.02□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.02□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 KIR3DS1Q14943 382 aa7.02□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.02□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.02□□□□□ -1.28
POLR2J3-215ENST00000511313 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 Q6ZQT7 251 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 Q6ZTC4 211 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 NUP35Q8NFH5 326 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 RAB37Q96AX2 223 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 A0A096LPF7 62 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 SNAI2O43623 268 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 LINC00614P0C842 121 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 PRAC2D3DTV9 90 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 D6R8Y8 96 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 CTAG1AP78358 180 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF124Q15973 351 aa7□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 SUMO4Q6EEV6 95 aa7□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 C9orf85Q96MD7 179 aa7□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 FABP4P15090 132 aa7□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 REG3AQ06141 175 aa7□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 RETNQ9HD89 108 aa7□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 SOCS3O14543 225 aa7□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 FGF6P10767 208 aa7□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 ANKRD39Q53RE8 183 aa7□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 CFAP126Q5VTH2 177 aa7□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 C20orf173Q96LM9 149 aa7□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 VAMP8Q9BV40 100 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 CDK2AP2O75956 126 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 DNAL4O96015 105 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 CST9LQ9H4G1 147 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 TRIOO75962 3097 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 SPEGQ15772 3267 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 TRGC2P03986 189 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 SPAG11BQ08648 103 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 CARD19Q96LW7 228 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 LEPROTO15243 131 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR2J3-215ENST00000511313 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms