RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495802.5

SKAP2-208, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-208	ENST00000495802	IFNA17	P01571	189 aa		0.06	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	SMCO1	Q147U7	214 aa		0.06	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		0.06	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	DAPK1	P53355	1430 aa		0.05	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	RYR3	Q15413	4870 aa		0.05	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	ANK2	Q01484	3957 aa		0.05	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	0.05	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	0.05	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	COPZ1	P61923	177 aa		0.05	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	INSL4	Q14641	139 aa		0.05	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	SPTSSA	Q969W0	71 aa		0.05	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	SDF2	Q99470	211 aa		0.05	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		0.05	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	BSN	Q9UPA5	3926 aa		0.05	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	0.05	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		0.05	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	RNF213	Q63HN8	5207 aa		0.04	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	CAD	P27708	2225 aa		0.04	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	NDUFB6	O95139	128 aa		0.04	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	CBLN1	P23435	193 aa		0.04	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	GCHFR	P30047	84 aa		0.04	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		0.04	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	PFDN5	Q99471	154 aa		0.04	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		0.04	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		0.04	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		0.04	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		0.04	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	0.04	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		0.03	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	0.03	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		0.03	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	SNCG	O76070	127 aa		0.03	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		0.03	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		0.03	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		0.03	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		0.03	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		0.03	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		0.03	□□□□□ -2.4
SKAP2-208	ENST00000495802	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		0.03	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	F8	P00451	2351 aa		0.03	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	0.03	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	GOLGA3	Q08378	1498 aa		0.03	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	RYR1	P21817	5038 aa		0.03	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	LAMB1	P07942	1786 aa		0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	COL7A1	Q02388	2944 aa		0.01	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		0.01	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		0.01	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802		G3V318	75 aa		0.01	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		0.01	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	DPH3	Q96FX2	82 aa		0.01	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		0.01	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	USH2A	O75445	5202 aa		0.01	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	CCL8	P80075	99 aa		0	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	HERC1	Q15751	4861 aa		0	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802		Q5VV11	94 aa		0	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		0	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		0	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		0	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	SEC11C	Q9BY50	192 aa		0	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	STAB1	Q9NY15	2570 aa		0	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		0	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	MYH6	P13533	1939 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	GRIN2A	Q12879	1464 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	IFT140	Q96RY7	1462 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM92A	A1XBS5	289 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF815P	A8K554	130 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	ARPC4	P59998	168 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802		U3KQA8	63 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	DNHD1	Q96M86	4753 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	COL6A3	P12111	3177 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	SMIM6	P0DI80	62 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	-0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	BAGE3	Q86Y29	109 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	KMT2A	Q03164	3969 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	LRRC37A3	O60309	1634 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	CREBBP	Q92793	2442 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	TNXB	P22105	4242 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	PARP14	Q460N5	1801 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	-0.03	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	HCG22	E2RYF7	251 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	PIN1P1	O15428	100 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	SIX6	O95475	246 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
SKAP2-208	ENST00000495802	LRP2	P98164	4655 aa		-0.03	□□□□□ -2.41

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