RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BAALCQ8WXS3 180 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UBE2WQ96B02 151 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SMIM12Q96EX1 92 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AP1S3Q96PC3 154 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CHCHD7Q9BUK0 85 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXB-AS3-215ENST00000494420 VAX2Q9UIW0 290 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C19orf71A6NCJ1 209 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DNAJC30Q96LL9 226 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXB-AS3-215ENST00000494420 XKRY2A2RUG3 117 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 P01737 135 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGLC6P0CF74 106 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AKAP14Q86UN6 197 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FRZBQ92765 325 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BIN3Q9NQY0 253 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MGPP08493 103 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CACNG7P62955 275 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HAMPP81172 84 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM70Q9BUB7 260 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CHCHD5Q9BSY4 110 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 F2Z2F3 143 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 Q0VG73 95 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM97Q5BJF2 176 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 Q5VSD8 79 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C15orf54Q8N8G6 183 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LYZL1Q6UWQ5 148 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C9orf62Q8N4C0 152 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 Q8N976 141 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 H7C1H1 209 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CRPP02741 224 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ANGP03950 147 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PKIAP61925 76 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MPV17L2Q567V2 206 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NUDT10Q8NFP7 164 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NUDT11Q96G61 164 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM30AQ9NZY2 134 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 M0QY20 66 aa12.71□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 INAFM2P0DMQ5 153 aa12.71□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SUMO4Q6EEV6 95 aa12.71□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C1orf43Q9BWL3 253 aa12.71□□□□□ -0.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM229AH3BQW9 127 aa12.7□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRGC1P0CF51 173 aa12.7□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NTF3P20783 257 aa12.7□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BLOC1S1P78537 153 aa12.7□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ATRAIDQ6UW56 229 aa12.7□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ENHOQ6UWT2 76 aa12.7□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ALKAL2Q6UX46 152 aa12.7□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GAGE6Q13070 117 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OCC1Q8TAD7 63 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 WDR73Q6P4I2 378 aa12.68□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DPH3P1Q9H4G8 78 aa12.68□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa12.67□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TWIST1Q15672 202 aa12.67□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RASL11AQ6T310 242 aa12.67□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAT1Q14517 4588 aa12.66□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 K7EN84 100 aa12.66□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RBX1P62877 108 aa12.66□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LINC01620Q4KN68 170 aa12.66□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CTRLP40313 264 aa12.65□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MIAQ16674 131 aa12.65□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IQCJQ1A5X6 159 aa12.65□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NIT2Q9NQR4 276 aa12.65□□□□□ -0.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM250H0YL14 139 aa12.64□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CEBPGP53567 150 aa12.64□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C14orf177Q52M58 125 aa12.64□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LINC00269Q8N2A0 174 aa12.64□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa12.64□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CLPSL2Q6UWE3 100 aa12.63□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DNAH8Q96JB1 4490 aa12.63□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GATCO43716 136 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HLA-DQA1P01909 254 aa12.62□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 Q6ZSA8 131 aa12.62□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LYPD6BQ8NI32 183 aa12.62□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa12.62□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM243Q9BU79 118 aa12.62□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CNFNQ9BYD5 112 aa12.62□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SMIM15Q7Z3B0 74 aa12.61□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRR34Q9NV39 138 aa12.61□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP17L23D6RBM5 183 aa12.6□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GTSF1Q8WW33 167 aa12.6□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 COTL1Q14019 142 aa12.59□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GATD1Q8NB37 220 aa12.59□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PGLYRP4Q96LB8 373 aa12.59□□□□□ -0.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa12.58□□□□□ -0.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A8MWL6 223 aa12.58□□□□□ -0.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UBE2L6O14933 153 aa12.58□□□□□ -0.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 REG3AQ06141 175 aa12.58□□□□□ -0.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM231DQ6ZW35 169 aa12.58□□□□□ -0.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms