RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493853.1

RBM39-238, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 4

Gene RBM39, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-238	ENST00000493853	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	SFRP2	Q96HF1	295 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	PAGE4	O60829	102 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	PFDN1	O60925	122 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853		Q8N976	141 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	BAALC	Q8WXS3	180 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	UBE2W	Q96B02	151 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853		Q9UF83	564 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	KLK12	Q9UKR0	248 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853		A0A1B0GV50	99 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	LTA	P01374	205 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	C1QB	P02746	253 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853		Q0VG73	95 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF56	Q15929	161 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	NIT1	Q86X76	327 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	CRP	P02741	224 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	RAB4B	P61018	213 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	SST	P61278	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853		A0A0D9SG52	128 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	NPS	P0C0P6	89 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	PKIA	P61925	76 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	WFDC2	Q14508	124 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	TMUB2	Q71RG4	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	UBE2D3	P61077	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	UBE2D2	P62837	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF345	Q14585	488 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853		G3V3Q6	166 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	CXCL1	P09341	107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	BCL2L11	O43521	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	SNAI2	O43623	268 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853		H7C1H1	209 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	MGP	P08493	103 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	GAGE6	Q13070	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	MIA	Q16674	131 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853		Q6ZSA8	131 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853	IFNA1	P01562	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-238	ENST00000493853		P01737	135 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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