RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		-1.69	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	NEB	P20929	6669 aa		-1.69	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	SPTA1	P02549	2419 aa		-1.69	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	NPFF	O15130	113 aa		-1.69	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		-1.69	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	-1.7	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		-1.7	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	CCDC179	H3BU77	68 aa		-1.7	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952		J3QLW9	94 aa		-1.7	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	-1.7	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	CLLU1	Q5K131	121 aa		-1.7	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		-1.7	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	BANF2	Q9H503	90 aa		-1.7	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	CALML5	Q9NZT1	146 aa		-1.7	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	IFT172	Q9UG01	1749 aa		-1.7	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		-1.7	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		-1.71	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	PAEP	P09466	180 aa		-1.71	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	HLA-DRB4	P13762	266 aa		-1.71	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	G0S2	P27469	103 aa		-1.71	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		-1.71	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		-1.71	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		-1.71	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		-1.71	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		-1.71	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		-1.71	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		-1.71	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	PARP14	Q460N5	1801 aa		-1.71	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	-1.71	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		-1.71	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	-1.72	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF609	O15014	1411 aa		-1.72	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	FAM92A	A1XBS5	289 aa		-1.72	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		-1.72	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	RBP4	P02753	201 aa		-1.72	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		-1.72	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952		Q5VV11	94 aa		-1.72	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		-1.72	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	C10orf82	Q8WW14	230 aa		-1.72	□□□□□ -2.68
TTC3-222	ENST00000491952	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	-1.72	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952		I3L2K1	104 aa		-1.73	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		-1.73	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	MNS1	Q8NEH6	495 aa		-1.73	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		-1.73	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		-1.73	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	-1.73	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	-1.73	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	PLXNB2	O15031	1838 aa		-1.73	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		-1.74	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	SMIM24	O75264	130 aa		-1.74	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	DPM2	O94777	84 aa		-1.74	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	UBE2D1	P51668	147 aa		-1.74	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	-1.74	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	LINC01545	Q5VT33	79 aa		-1.74	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	LRP6	O75581	1613 aa		-1.74	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		-1.75	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952		J3KT08	172 aa		-1.75	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	SPRR1B	P22528	89 aa		-1.75	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	BAGE3	Q86Y29	109 aa		-1.75	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		-1.75	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		-1.76	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		-1.76	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	ROCK1	Q13464	1354 aa		-1.76	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	ERCC6	Q03468	1493 aa		-1.76	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		-1.76	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		-1.77	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		-1.77	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		-1.77	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		-1.78	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952		M0R2T5	61 aa		-1.78	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	SPRR2A	P35326	72 aa		-1.78	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	GNG10	P50151	68 aa		-1.78	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	-1.78	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	TSC2	P49815	1807 aa		-1.78	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		-1.78	□□□□□ -2.69
TTC3-222	ENST00000491952	YPEL1	O60688	119 aa		-1.79	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	SMIM6	P0DI80	62 aa		-1.79	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	-1.79	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		-1.79	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		-1.8	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	RPRM	Q9NS64	109 aa		-1.8	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	-1.8	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	PIRT	P0C851	137 aa		-1.81	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	S100A3	P33764	101 aa		-1.81	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	UBE2G1	P62253	170 aa		-1.81	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		-1.81	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		-1.81	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		-1.82	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	E2F6	O75461	281 aa		-1.82	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	COX6B1	P14854	86 aa		-1.82	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		-1.82	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	MIC13	Q5XKP0	118 aa		-1.82	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		-1.82	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		-1.82	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	-1.83	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	SYNJ1	O43426	1573 aa		-1.83	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952		E5RI56	91 aa		-1.83	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952		M0R129	80 aa		-1.83	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	TNFSF15	O95150	251 aa		-1.83	□□□□□ -2.7
TTC3-222	ENST00000491952	SPRR2E	P22531	72 aa		-1.83	□□□□□ -2.7

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms