RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292		H3BUX3	64 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	LAMA5	O15230	3695 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	POLQ	O75417	2590 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHV3-33	P01772	117 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292		P0DMU3	169 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM231A	P0DMU4	169 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM231C	P0DMU5	169 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	SYNJ2BP	P57105	145 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	UBE2E1	P51965	193 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	UBE2D3	P61077	147 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	UBE2D2	P62837	147 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ERCC3-208	ENST00000491292	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	OOSP1	A8MZH6	123 aa		7.4	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIAP1	O43715	76 aa		7.4	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		7.4	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	BLCAP	P62952	87 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	LEPROT	O15243	131 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	CRYGD	P07320	174 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	JMJD1C	Q15652	2540 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	ELANE	P08246	267 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	PRM2	P04554	102 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	EDN2	P20800	178 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	PIP4P1	Q86T03	277 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	RHOD	O00212	210 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	AKAP13	Q12802	2813 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	ODF3B	A8MYP8	253 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292		I3L3M4	83 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292		Q8NA96	180 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A0J9YXY3	114 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	TSHB	P01222	138 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHV3-53	P01767	116 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	PROK1	P58294	105 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF575	Q86XF7	245 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	SVIP	Q8NHG7	77 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	GPHB5	Q86YW7	130 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM101	Q96IK0	257 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	TIMM17A	Q99595	171 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	IGIP	A6NJ69	53 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	NDUFA4	O00483	81 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	COX6B1	P14854	86 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	NBL1	P41271	181 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	CDSN	Q15517	529 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC01587	Q99440	93 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	DNAL4	O96015	105 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM223B	A6NKX1	122 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	CENPE	Q02224	2701 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC01619	G3V211	115 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	MUC4	Q99102	2169 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM223	A0PJW6	202 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC01546	A6NGU7	62 aa		7.34	□□□□□ -1.24
ERCC3-208	ENST00000491292	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		7.34	□□□□□ -1.24
ERCC3-208	ENST00000491292	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		7.34	□□□□□ -1.24
ERCC3-208	ENST00000491292		Q9H8V8	135 aa		7.33	□□□□□ -1.24

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