RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	BORCS7	Q96B45	105 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1B0GW15	77 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290		K7EP13	123 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	SST	P61278	116 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290		F8W036	122 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	MT-ND4L	P03901	98 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	RIG	Q13278	110 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	TTC32	Q5I0X7	151 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	GATD1	Q8NB37	220 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A087WWC5	75 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1B0GXF2	115 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290		F5H697	171 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	SIVA1	O15304	175 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	MGP	P08493	103 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	RASL11A	Q6T310	242 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		11.29	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	RNF185	Q96GF1	192 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	IMMP2L	Q96T52	175 aa		11.28	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
HCLS1-208	ENST00000487290	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		11.27	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		11.27	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	NIT2	Q9NQR4	276 aa		11.27	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	PKD1	P98161	4303 aa		11.27	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		11.26	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		11.26	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		11.26	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	MRAP2	Q96G30	205 aa		11.26	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		11.26	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		11.25	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	S100A8	P05109	93 aa		11.25	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB4A	P20338	218 aa		11.25	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	HBB	P68871	147 aa		11.25	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		11.24	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		11.24	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		11.24	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		11.24	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		11.24	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		11.24	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		11.23	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290		M0R2N4	97 aa		11.23	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	RTL8C	O15255	209 aa		11.23	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	RHEB	Q15382	184 aa		11.23	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	AMN1	Q8IY45	258 aa		11.23	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	C6orf223	Q8N319	242 aa		11.22	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	LAGE3	Q14657	143 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	NIT1	Q86X76	327 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	BTF3L4	Q96K17	158 aa		11.21	□□□□□ -0.61
HCLS1-208	ENST00000487290	PKHD1	P08F94	4074 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	GAS8-AS1	O95177	125 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	PPP1R17	O96001	155 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	NRAC	Q8N912	160 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	CAMP	P49913	170 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	PKIA	P61925	76 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	NCR2	O95944	276 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	SVBP	Q8N300	66 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	PHOX2A	O14813	284 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	PPBP	P02775	128 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	COTL1	Q14019	142 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	NDUFA5	Q16718	116 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	NFE4	Q86UQ8	179 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HCLS1-208	ENST00000487290	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62

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