RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZRP5 223 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 KIR2DL5AQ8N109 375 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 SFRP2Q96HF1 295 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 OVOL2Q9BRP0 275 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 LY96Q9Y6Y9 160 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 V9GYV3 84 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 DNAH9Q9NYC9 4486 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 MT-ND4LP03901 98 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 ARMS2P0C7Q2 107 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 S100A4P26447 101 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 RRN3P1Q2M238 152 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 LYZL1Q6UWQ5 148 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 FAM231DQ6ZW35 169 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 C15orf54Q8N8G6 183 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 GTSF1Q8WW33 167 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 PGLYRP4Q96LB8 373 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 OSTCQ9NRP0 149 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 MUC4Q99102 2169 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 HIGD1CA8MV81 97 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 M0R381 172 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 NXPH4O95158 308 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 SNAPINO95295 136 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 ASIPP42127 132 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM256Q8N2U0 113 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 SVBPQ8N300 66 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 Q8NBF4 154 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 C11orf72Q8NBR9 251 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 NUP35Q8NFH5 326 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 OR10AG1Q8NH19 301 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 SMIM12Q96EX1 92 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 KCNS1Q96KK3 526 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 B9D2Q9BPU9 175 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 JPT2Q9H910 190 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 Q9HAA7 133 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 BIN3Q9NQY0 253 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 CELA1Q9UNI1 258 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 TENM3Q9P273 2699 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 PLAC8L1A1L4L8 177 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 A8MWL6 223 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-53P01767 116 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 IGLC6P0CF74 106 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 DEFB130BP0DP73 79 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 DEFB130AP0DP74 79 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 RPS20P60866 119 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 TDRG1Q3Y452 100 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 LCE3AQ5TA76 89 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZTI0 123 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 CBLN2Q8IUK8 224 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 Q8N377 158 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 Q8NAQ8 132 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 TSKUQ8WUA8 353 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 RASL10AQ92737 203 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 C16orf74Q96GX8 76 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 C9orf85Q96MD7 179 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 C20orf144Q9BQM9 153 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 IL36BQ9NZH7 164 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 COL7A1Q02388 2944 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 XKRY2A2RUG3 117 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 SMIM9A6NGZ8 99 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R2P9O14990 202 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 MIFP14174 115 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 HTN3P15516 51 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 NTF3P20783 257 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 S100A1P23297 94 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 RHEBQ15382 184 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 FAM222AQ5U5X8 452 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 SPANXN1Q5VSR9 72 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00467Q9BRT7 94 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 SAMD10Q9BYL1 202 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 NACAE9PAV3 2078 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 A0A087WWC5 75 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GUT8 65 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 M0R2P5 195 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 SNAI2O43623 268 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 CXCL1P09341 107 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-211ENST00000484135 OR5AL1P0C617 328 aa3.29□□□□□ -1.88
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