RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483051.5

TTLL3-228, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 5

Gene TTLL3, Length 4,176 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-228ENST00000483051 CRIP1P50238 77 aa6.68□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 RNF7Q9UBF6 113 aa6.68□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 UBE2D3P61077 147 aa6.68□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 UBE2D2P62837 147 aa6.68□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.68□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 USP17L23D6RBM5 183 aa6.68□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.68□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.67□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 P0C879 139 aa6.67□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 GP9P14770 177 aa6.67□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 ZNF876PQ49A33 203 aa6.67□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.67□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.67□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.67□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.67□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 SERP2Q8N6R1 65 aa6.66□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 PIFOQ8TCI5 191 aa6.66□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.66□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.66□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 LRP4O75096 1905 aa6.66□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.66□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 H3BT86 120 aa6.66□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.66□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 Q96MF0 132 aa6.66□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 ACYP1P07311 99 aa6.66□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 FAM27E3Q08E93 113 aa6.66□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.66□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.66□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 SOCS3O14543 225 aa6.65□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 IGHG2P01859 326 aa6.65□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 A8MZ25 164 aa6.65□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 UBE2D1P51668 147 aa6.65□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TTLL3-228ENST00000483051 I3L3M4 83 aa6.65□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 NBR2O15453 112 aa6.65□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.65□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.65□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 IGHV3-30P01768 117 aa6.65□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.65□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.65□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.65□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 COPS9Q8WXC6 57 aa6.64□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.64□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 C19orf84I3L1E1 186 aa6.64□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 ATP5G1P05496 136 aa6.64□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.64□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 F8P00451 2351 aa6.63□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 C15orf65H3BRN8 121 aa6.63□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 DEFB1P60022 68 aa6.63□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 GGNQ86UU5 652 aa6.63□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.63□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 F8WDY8 70 aa6.63□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 PAX4O43316 350 aa6.63□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 PSMB8P28062 276 aa6.63□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 SS18Q15532 418 aa6.63□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.63□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.63□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 PINLYPA6NC86 204 aa6.63□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.63□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 ENHOQ6UWT2 76 aa6.63□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 CRPP02741 224 aa6.62□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 LINC00158P58513 81 aa6.62□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.62□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 HIVEP2P31629 2446 aa6.62□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.62□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 PRAC2D3DTV9 90 aa6.62□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.62□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.62□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 TIRAPP58753 221 aa6.62□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.62□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.62□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 SPANXCQ9NY87 97 aa6.62□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 VCYO14598 125 aa6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 SLPIP03973 132 aa6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 RITA1Q96K30 269 aa6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 ZNF580Q9UK33 172 aa6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 HILS1P60008 231 aa6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 UBL5Q9BZL1 73 aa6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 GNRH2O43555 120 aa6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 LINC00311Q8N616 119 aa6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 RNF185Q96GF1 192 aa6.61□□□□□ -1.35
TTLL3-228ENST00000483051 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms