RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 COL7A1Q02388 2944 aa9.14□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.13□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.13□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 MUC7Q8TAX7 377 aa9.13□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 VSIG2Q96IQ7 327 aa9.13□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 C20orf78Q9BR46 151 aa9.13□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.13□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 D6R8Y8 96 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 GYPEP15421 78 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 LINC00694P0DN24 101 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 SRIP30626 198 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 NRACQ8N912 160 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 PRELID3AQ96N28 172 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 A0A0J9YY99 117 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 C3orf84H3BNL1 204 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 ST20Q9HBF5 79 aa9.1□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 PRSS47A8MTI9 375 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 IGLL5B9A064 214 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 TCAPO15273 167 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 TNFRSF6BO95407 300 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 NCR2O95944 276 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 TIRAPP58753 221 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 UBE2D3P61077 147 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 UBE2D2P62837 147 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.09□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 GAGE12JA6NER3 117 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 P0DMU3 169 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 FAM231AP0DMU4 169 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 FAM231CP0DMU5 169 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 GAGE1Q13065 139 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 GAGE4Q13068 117 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 GAGE5Q13069 117 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 GAGE13Q4V321 117 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 A0A096LPF7 62 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 SMKR1H3BMG3 65 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 K7EMI3 77 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 VCYO14598 125 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 TRGC2P03986 189 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.07□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 I3L3M4 83 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 NUDT3O95989 172 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 NPYP01303 97 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 PMCHP20382 165 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 KIAA1644Q3SXP7 199 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 GAS8-AS1O95177 125 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 KIR2DL4Q99706 377 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 APLNQ9ULZ1 77 aa9.05□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 COTL1Q14019 142 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 Q9UF83 564 aa9.04□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 CCL18P55774 89 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 RAB5BP61020 215 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 Q8N8P6 123 aa9.03□□□□□ -0.96
NISCH-208ENST00000481211 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 G0S2P27469 103 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 PKIAP61925 76 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 Q0VG73 95 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 CASC10Q5T4H9 136 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 LELP1Q5T871 98 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 C18orf32Q8TCD1 76 aa9.02□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.01□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.01□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.01□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.01□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 FCER1GP30273 86 aa9.01□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 IQCJQ1A5X6 159 aa9.01□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 ORMDL2Q53FV1 153 aa9.01□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.01□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 LINC01546A6NGU7 62 aa9□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 LINC01549A6NIU2 74 aa9□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 H7C423 109 aa9□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9□□□□□ -0.97
NISCH-208ENST00000481211 UPK3BQ9BT76 320 aa9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.4 ms