RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa5.39□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 BUB3O43684 328 aa5.39□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 LYZP61626 148 aa5.39□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 NPC2P61916 151 aa5.39□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 Q1RN00 199 aa5.39□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 ZNF876PQ49A33 203 aa5.39□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 VSIG2Q96IQ7 327 aa5.39□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.39□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.39□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa5.39□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 DOCK7Q96N67 2140 aa5.39□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.38□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.38□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.38□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 hADV29S1A0JD25 119 aa5.38□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 IGIPA6NJ69 53 aa5.38□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 I3L2K1 104 aa5.38□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 IGKV3-15P01624 115 aa5.38□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 PRB1P04280 392 aa5.38□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.38□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 ZNF843Q8N446 348 aa5.38□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.38□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 DCTN5Q9BTE1 182 aa5.38□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 PCNX1Q96RV3 2341 aa5.38□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.38□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa5.37□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.37□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 M0R3E3 92 aa5.37□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 IGKV1-17P01599 117 aa5.37□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 PFN2P35080 140 aa5.37□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 C4orf26Q17RF5 130 aa5.37□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.37□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 ZNF826PQ6ZT77 177 aa5.37□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 Q75L30 129 aa5.37□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.37□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 Q8N3U1 123 aa5.37□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 TMEM86BQ8N661 226 aa5.37□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.37□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.37□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 DEFB127Q9H1M4 99 aa5.37□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 SPRR3Q9UBC9 169 aa5.37□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 FREM1Q5H8C1 2179 aa5.37□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 IGHV4-39P01824 125 aa5.36□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 RHOHQ15669 191 aa5.36□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 SFTA2Q6UW10 78 aa5.36□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.36□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa5.36□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.36□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa5.36□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 DSCAMO60469 2012 aa5.36□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 CHD6Q8TD26 2715 aa5.36□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.35□□□□□ -1.55
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PKP4-211ENST00000481115 NDUFC1O43677 76 aa5.35□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 IGLV1-44P01699 117 aa5.35□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 IGHV3-9P01782 118 aa5.35□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa5.35□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.35□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.35□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 GFRALQ6UXV0 394 aa5.35□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 APRG1Q8IVJ8 170 aa5.35□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 FAM19A4Q96LR4 140 aa5.35□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 NBEAQ8NFP9 2946 aa5.34□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 ZNHIT1O43257 154 aa5.34□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 IGHG2P01859 326 aa5.34□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 SYNJ2BPP57105 145 aa5.34□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 MIAQ16674 131 aa5.34□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.34□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 Q6ZT83 130 aa5.34□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 TMEM61Q8N0U2 210 aa5.34□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.34□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 IL17DQ8TAD2 202 aa5.34□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.34□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.34□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 RNF7Q9UBF6 113 aa5.34□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PKP4-211ENST00000481115 ZNF462Q96JM2 2506 aa5.34□□□□□ -1.56
PKP4-211ENST00000481115 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.33□□□□□ -1.56
PKP4-211ENST00000481115 RELNP78509 3460 aa5.33□□□□□ -1.56
PKP4-211ENST00000481115 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PKP4-211ENST00000481115 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa5.33□□□□□ -1.56
PKP4-211ENST00000481115 H3BTX0 84 aa5.33□□□□□ -1.56
PKP4-211ENST00000481115 I3L3M4 83 aa5.33□□□□□ -1.56
PKP4-211ENST00000481115 NXPH4O95158 308 aa5.33□□□□□ -1.56
PKP4-211ENST00000481115 GAS8-AS1O95177 125 aa5.33□□□□□ -1.56
PKP4-211ENST00000481115 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PKP4-211ENST00000481115 GNLYP22749 145 aa5.33□□□□□ -1.56
PKP4-211ENST00000481115 UBE2E1P51965 193 aa5.33□□□□□ -1.56
PKP4-211ENST00000481115 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PKP4-211ENST00000481115 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa5.33□□□□□ -1.56
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