RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477057.5

FDPS-211, Transcript of farnesyl diphosphate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene FDPS, Length 741 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPS-211ENST00000477057 UBE2D2P62837 147 aa8.61□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 CLLU1Q5K131 121 aa8.61□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 WDR73Q6P4I2 378 aa8.61□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.6□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 A0A1B0GUT8 65 aa8.6□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 TMEM262E9PQX1 116 aa8.6□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 TNP2Q05952 138 aa8.6□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 RASL11AQ6T310 242 aa8.6□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 V9GYV3 84 aa8.6□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 A0A087WX48 190 aa8.59□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 PSCAO43653 123 aa8.59□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 IFITM2Q01629 132 aa8.59□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.59□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 NFE4Q86UQ8 179 aa8.59□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 Q8N3U1 123 aa8.59□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.59□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.59□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 CNFNQ9BYD5 112 aa8.59□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.59□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.59□□□□□ -1.03
FDPS-211ENST00000477057 M0QY20 66 aa8.58□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 RIGQ13278 110 aa8.58□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.58□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.57□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 K7EP13 123 aa8.57□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 NUP35Q8NFH5 326 aa8.57□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.56□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.56□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 FAM231BA6NCW3 169 aa8.56□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 EREGO14944 169 aa8.56□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 CAMPP49913 170 aa8.56□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.56□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 COMMD7Q86VX2 200 aa8.56□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 NIT2Q9NQR4 276 aa8.56□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 GAGE6Q13070 117 aa8.55□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 NIT1Q86X76 327 aa8.55□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 GATD1Q8NB37 220 aa8.55□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 KLK12Q9UKR0 248 aa8.55□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.54□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.54□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 F8W036 122 aa8.54□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 PPP1R2P9O14990 202 aa8.54□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 CRPP02741 224 aa8.54□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 COTL1Q14019 142 aa8.54□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 AMN1Q8IY45 258 aa8.54□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 A0A1B0GVY2 172 aa8.53□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.53□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 UBE2L6O14933 153 aa8.53□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 NCR2O95944 276 aa8.53□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 MT-ND4LP03901 98 aa8.53□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 AMTP48728 403 aa8.53□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 PKIAP61925 76 aa8.53□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 ELOBQ15370 118 aa8.53□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 UQCC3Q6UW78 93 aa8.53□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.53□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 UBE2WQ96B02 151 aa8.53□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.53□□□□□ -1.04
FDPS-211ENST00000477057 SMKR1H3BMG3 65 aa8.52□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 MPV17L2Q567V2 206 aa8.52□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.52□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.52□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 TMEM243Q9BU79 118 aa8.52□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.51□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.51□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.51□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 C16orf90A8MZG2 172 aa8.51□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 S100A8P05109 93 aa8.51□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 PMCHP20382 165 aa8.51□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 HBBP68871 147 aa8.51□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 LAGE3Q14657 143 aa8.51□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 Q8N976 141 aa8.51□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.51□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 RMI2Q96E14 147 aa8.51□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 MRAP2Q96G30 205 aa8.51□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.51□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 TM2D2Q9BX73 214 aa8.51□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 ST20Q9HBF5 79 aa8.51□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 TMEM218A2RU14 115 aa8.5□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 APCSP02743 223 aa8.5□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 RAB4AP20338 218 aa8.5□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.5□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 FRZBQ92765 325 aa8.5□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 A0A1B0GW15 77 aa8.49□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 GAS8-AS1O95177 125 aa8.49□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 IQCJQ1A5X6 159 aa8.49□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.49□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 RNF185Q96GF1 192 aa8.49□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 A0A087WTM6 91 aa8.48□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 I3L3M4 83 aa8.48□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 ADCYAP1P18509 176 aa8.48□□□□□ -1.05
FDPS-211ENST00000477057 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.058e-9■■□□□ 13.1
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