RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468164.1

C9orf3-212, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 849 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-212ENST00000468164 DERL1Q9BUN8 251 aa8.9□□□□□ -0.98
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C9orf3-212ENST00000468164 RAB19A4D1S5 217 aa8.89□□□□□ -0.99
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C9orf3-212ENST00000468164 PKIAP61925 76 aa8.79□□□□□ -1
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C9orf3-212ENST00000468164 PEA15Q15121 130 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-212ENST00000468164 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-212ENST00000468164 Q6ZSA8 131 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-212ENST00000468164 SCXQ7RTU7 201 aa8.79□□□□□ -1
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C9orf3-212ENST00000468164 C14orf177Q52M58 125 aa8.78□□□□□ -1
C9orf3-212ENST00000468164 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.78□□□□□ -1
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C9orf3-212ENST00000468164 M0QY20 66 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 MIAQ16674 131 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 TRGC1P0CF51 173 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 NTF3P20783 257 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-212ENST00000468164 A8MWL6 223 aa8.75□□□□□ -1.01
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