RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 M0R381 172 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 SIVA1O15304 175 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 OR5AL1P0C617 328 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 CRYBA4P53673 196 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 CACNG7P62955 275 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 Q5VSD8 79 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GUT8 65 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 K7EP13 123 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 GYPEP15421 78 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 SRIP30626 198 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 RIGQ13278 110 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 ZFP82Q8N141 532 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 YPEL4Q96NS1 127 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 FAM229AH3BQW9 127 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 CAMPP49913 170 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 TWIST1Q15672 202 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 SYT8Q8NBV8 401 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GXF2 115 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 K7EQD1 137 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 NTF3P20783 257 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 RAB4BP61018 213 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 HBBP68871 147 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 CNFNQ9BYD5 112 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PRAME-210ENST00000442481 COLCA2A8K830 154 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 RS1O15537 224 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 NXPH4O95158 308 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 WDR73Q6P4I2 378 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GW15 77 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 S100A8P05109 93 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 TRGC1P0CF51 173 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 XGP55808 180 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 AP1S3Q96PC3 154 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 JPT2Q9H910 190 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 FAT1Q14517 4588 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 A8MWV9 139 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 RAB5AP20339 215 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 RHOHQ15669 191 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 COX19Q49B96 90 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 RASL11AQ6T310 242 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZSN1 163 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 PTH2Q96A98 100 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 A0A087WTM6 91 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 A0A087WWL8 130 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 J3QL48 77 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 CIDEAO60543 219 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 MGPP08493 103 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 SMIM17P0DL12 118 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 EVI2AP22794 236 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 GCSHP23434 173 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.93□□□□□ -1.143e-10■□□□□ 9.6
PRAME-210ENST00000442481 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 MYCBP2O75592 4640 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 HLA-DQA1P01909 254 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 AMN1Q8IY45 258 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 GATD1Q8NB37 220 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 GAGE12JA6NER3 117 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 RHODO00212 210 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 MT-ND6P03923 174 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 GAGE1Q13065 139 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 GAGE4Q13068 117 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 GAGE5Q13069 117 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 GAGE13Q4V321 117 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-210ENST00000442481 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.91□□□□□ -1.14
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