RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439555.2

IRF1-204, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene IRF1, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-204ENST00000439555 ZNF56Q15929 161 aa7.55□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.55□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 BAALCQ8WXS3 180 aa7.55□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 UBE2WQ96B02 151 aa7.55□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.55□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 VAX2Q9UIW0 290 aa7.55□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.55□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.54□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 PDE6DO43924 150 aa7.54□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 SMIM17P0DL12 118 aa7.54□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.54□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 AP1S3Q96PC3 154 aa7.54□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 DERL1Q9BUN8 251 aa7.54□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 XKRY2A2RUG3 117 aa7.53□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.53□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 TMEM262E9PQX1 116 aa7.53□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 F2Z2F3 143 aa7.53□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 F5H697 171 aa7.53□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 LECT2O14960 151 aa7.53□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 IGLV2-8P01709 118 aa7.53□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 IGLC6P0CF74 106 aa7.53□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 CENPWQ5EE01 88 aa7.53□□□□□ -1.2
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IRF1-204ENST00000439555 BIN3Q9NQY0 253 aa7.53□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.53□□□□□ -1.2
IRF1-204ENST00000439555 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
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IRF1-204ENST00000439555 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.52□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 H7C1H1 209 aa7.52□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 IFNA1P01562 189 aa7.52□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 GNG4P50150 75 aa7.52□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 CACNG7P62955 275 aa7.52□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 C14orf177Q52M58 125 aa7.52□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 ENHOQ6UWT2 76 aa7.52□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 SLC51BQ86UW2 128 aa7.52□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.52□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.52□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.52□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.52□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 M0QY20 66 aa7.51□□□□□ -1.21
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IRF1-204ENST00000439555 IQCJQ1A5X6 159 aa7.51□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 WDR73Q6P4I2 378 aa7.51□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.51□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.51□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 PRR34Q9NV39 138 aa7.51□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.5□□□□□ -1.21
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IRF1-204ENST00000439555 P01737 135 aa7.5□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 CRPP02741 224 aa7.5□□□□□ -1.21
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IRF1-204ENST00000439555 SSTP61278 116 aa7.49□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.48□□□□□ -1.21
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IRF1-204ENST00000439555 TPPP3Q9BW30 176 aa7.48□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 CNFNQ9BYD5 112 aa7.48□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 A0A1B0GUV1 79 aa7.47□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 NTF3P20783 257 aa7.47□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 CTRLP40313 264 aa7.47□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.47□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.47□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 RASL11AQ6T310 242 aa7.47□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.47□□□□□ -1.21
IRF1-204ENST00000439555 SCXQ7RTU7 201 aa7.47□□□□□ -1.21
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IRF1-204ENST00000439555 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.46□□□□□ -1.22
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IRF1-204ENST00000439555 NUDT11Q96G61 164 aa7.46□□□□□ -1.22
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IRF1-204ENST00000439555 LINC01620Q4KN68 170 aa7.45□□□□□ -1.22
IRF1-204ENST00000439555 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.45□□□□□ -1.22
IRF1-204ENST00000439555 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.45□□□□□ -1.22
IRF1-204ENST00000439555 TMEM243Q9BU79 118 aa7.45□□□□□ -1.22
IRF1-204ENST00000439555 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
IRF1-204ENST00000439555 BLOC1S1P78537 153 aa7.44□□□□□ -1.22
IRF1-204ENST00000439555 REG3AQ06141 175 aa7.44□□□□□ -1.22
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