RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439128.6

NEK1-201, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 5,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-201ENST00000439128 C9JQL5 133 aa9.12□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 K7EMI3 77 aa9.12□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 REG3AQ06141 175 aa9.12□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 P0DMU3 169 aa9.12□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 FAM231AP0DMU4 169 aa9.12□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 FAM231CP0DMU5 169 aa9.12□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 Q6ZS46 218 aa9.12□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.11□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.11□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 LY6LH3BQJ8 138 aa9.11□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 OCIAD2Q56VL3 154 aa9.11□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 A0A0J9YXV3 536 aa9.11□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa9.11□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 MPV17L2Q567V2 206 aa9.11□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 LINC00574Q9H8X3 128 aa9.11□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 RPL39P62891 51 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 DKK2Q9UBU2 259 aa9.11□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 PCDH15Q96QU1 1955 aa9.11□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 EBI3Q14213 229 aa9.1□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 DOCK11Q5JSL3 2073 aa9.1□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa9.1□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.1□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 IGF2RP11717 2491 aa9.1□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 NUPR2A6NF83 97 aa9.1□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 LECT2O14960 151 aa9.1□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 CXCL5P42830 114 aa9.1□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.09□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 IGLC2P0DOY2 106 aa9.09□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.09□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.09□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 MED14OSP0DP75 135 aa9.09□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.09□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.09□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.09□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 TNCP24821 2201 aa9.09□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 UBL5Q9BZL1 73 aa9.09□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.09□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 ATRXP46100 2492 aa9.09□□□□□ -0.95
NEK1-201ENST00000439128 ADCYAP1P18509 176 aa9.08□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 U3KQK5 164 aa9.08□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 NAV2Q8IVL1 2488 aa9.08□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 UBE2D1P51668 147 aa9.08□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.08□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 C20orf173Q96LM9 149 aa9.07□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 RETNQ9HD89 108 aa9.07□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.07□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 HIGD2AQ9BW72 106 aa9.07□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 NACAE9PAV3 2078 aa9.07□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 FREM1Q5H8C1 2179 aa9.06□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 CCDC168Q8NDH2 2452 aa9.06□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa9.06□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.06□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 NDUFB1O75438 58 aa9.06□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 KIR2DL5AQ8N109 375 aa9.06□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.06□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 ODF3Q96PU9 254 aa9.06□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 MAJINQ3KP22 176 aa9.06□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa9.05□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 ORMDL1Q9P0S3 153 aa9.05□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.05□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa9.05□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.05□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 MTURNQ8N3F0 131 aa9.05□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 IL15RAQ13261 267 aa9.05□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 LYPD6Q86Y78 171 aa9.05□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa9.04□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 DAND5Q8N907 189 aa9.04□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 PRSS47A8MTI9 375 aa9.04□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 CRYGBP07316 175 aa9.04□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 CARD19Q96LW7 228 aa9.04□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.04□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 ALPK3Q96L96 1907 aa9.03□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 A0A096LNI7 61 aa9.03□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.03□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 BRI3O95415 125 aa9.03□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 MED12LQ86YW9 2145 aa9.02□□□□□ -0.96
NEK1-201ENST00000439128 A0A1W2PPR1 153 aa9.02□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 DIRC1Q969H9 104 aa9.02□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.02□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 Q6ZUT4 128 aa9.02□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 IGLV1-40P01703 118 aa9.01□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 CEND1Q8N111 149 aa9.01□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.01□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 ZNF747Q9BV97 191 aa9□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 Q8N6K4 173 aa9□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 C9orf85Q96MD7 179 aa9□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 PTPRSQ13332 1948 aa9□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 TRACP01848 142 aa9□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.99□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.8 ms