RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422770.5

HERC3-204, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-204ENST00000422770 RS1O15537 224 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 COX19Q49B96 90 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 RASL11AQ6T310 242 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 F5H697 171 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 SMKR1H3BMG3 65 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 K7EQD1 137 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 APCSP02743 223 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 RHOHQ15669 191 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 GATD1Q8NB37 220 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 PTH2Q96A98 100 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 Q9H8V8 135 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 D6R8Y8 96 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 SIVA1O15304 175 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 CIDEAO60543 219 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 TTC32Q5I0X7 151 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 RNF185Q96GF1 192 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 GAGE12JA6NER3 117 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 TRGC2P03986 189 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 CRYGDP07320 174 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 RAB4AP20338 218 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 CKS2P33552 79 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 GAGE1Q13065 139 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 GAGE4Q13068 117 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 GAGE5Q13069 117 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 GAGE13Q4V321 117 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 Q6ZR54 194 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 MRAP2Q96G30 205 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.66□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 ORMDL3Q8N138 153 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 PRELID3AQ96N28 172 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 UPK3BQ9BT76 320 aa6.65□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HERC3-204ENST00000422770 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 H7C1H1 209 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 RTL8CO15255 209 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 GAS8-AS1O95177 125 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 NPYP01303 97 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 LINC00315P59091 139 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 Q6ZSN1 163 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 C6orf223Q8N319 242 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 RAB5BP61020 215 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 IQCJQ1A5X6 159 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 TNFRSF6BO95407 300 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 PPBPP02775 128 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 NRACQ8N912 160 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 KMT2AQ03164 3969 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 M0QY20 66 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 IGHV3-30P01768 117 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 IGHV3-33P01772 117 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 ST20Q9HBF5 79 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 PHOX2AO14813 284 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 HIST1H2BKO60814 126 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 HIST1H2BJP06899 126 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 HIST1H2BOP23527 126 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-204ENST00000422770 HIST1H2BBP33778 126 aa6.6□□□□□ -1.35
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