RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB5BP61020 215 aa11.9□□□□□ -0.5
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TOP3BP1-201ENST00000420768 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.9□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP1LC3AQ9H492 121 aa11.9□□□□□ -0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 ST20Q9HBF5 79 aa11.9□□□□□ -0.5
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TOP3BP1-201ENST00000420768 HIST1H2BOP23527 126 aa11.88□□□□□ -0.51
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TOP3BP1-201ENST00000420768 HIST1H2BMQ99879 126 aa11.88□□□□□ -0.51
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TOP3BP1-201ENST00000420768 GAGE1Q13065 139 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 GAGE4Q13068 117 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 GAGE5Q13069 117 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 GAGE13Q4V321 117 aa11.85□□□□□ -0.51
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TOP3BP1-201ENST00000420768 I3L3M4 83 aa11.82□□□□□ -0.52
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TOP3BP1-201ENST00000420768 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.81□□□□□ -0.52
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TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00614P0C842 121 aa11.8□□□□□ -0.52
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TOP3BP1-201ENST00000420768 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.8□□□□□ -0.52
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TOP3BP1-201ENST00000420768 IGLL5B9A064 214 aa11.77□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 SERF1AO75920 110 aa11.77□□□□□ -0.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUDT3O95989 172 aa11.77□□□□□ -0.53
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TOP3BP1-201ENST00000420768 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa11.77□□□□□ -0.53
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