RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390364.3

TRBV10-1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 10-1(gene/pseudogene), humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV10-1, Length 412 nt, Biotype TR V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-1-201ENST00000390364 PLNP26678 52 aa6.57□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.57□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.57□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.57□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.56□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.56□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.56□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 ZFHX3Q15911 3703 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 IGHV3-53P01767 116 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 APOC4P55056 127 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 RIPPLY3P57055 190 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 CTAG1AP78358 180 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 ODF1Q14990 250 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 MAJINQ3KP22 176 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 TIMM17AQ99595 171 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 ZMAT4Q9H898 229 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 ACANP16112 2415 aa6.55□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.54□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.54□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 F8VRH5 84 aa6.54□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 COX8AP10176 69 aa6.54□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 PMVKQ15126 192 aa6.54□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.54□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 C3orf56Q8N813 242 aa6.54□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.54□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 DKK2Q9UBU2 259 aa6.54□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.54□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.54□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 PRM2P04554 102 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.53□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TRBV10-1-201ENST00000390364 SIVA1O15304 175 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 DLEU1O43261 78 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 NPSP0C0P6 89 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 HERVK_113P61574 105 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 TNP2Q05952 138 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 COTL1Q14019 142 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 STPG4Q8N801 248 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 IL17DQ8TAD2 202 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 BAALCQ8WXS3 180 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 VCX2Q9H322 139 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 AKAP9Q99996 3911 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 MUC4Q99102 2169 aa6.52□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 MAST4O15021 2626 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 AGRNO00468 2067 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 IGIPA6NJ69 53 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 TSHBP01222 138 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 NMUP48645 174 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 CRYBA4P53673 196 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 BATFQ16520 125 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 CFAP161Q6P656 301 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.51□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 GAGE12BA1L429 117 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 K7EQD1 137 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 GAGE7O76087 117 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 GAGE12FP0CL80 117 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 GAGE12GP0CL81 117 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 GAGE12IP0CL82 117 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 Q6ZTI0 123 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.5□□□□□ -1.37
TRBV10-1-201ENST00000390364 CST9LQ9H4G1 147 aa6.5□□□□□ -1.37
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