RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.73□□□□□ -1.33
CLRN3-201ENST00000368671 C14orf177Q52M58 125 aa6.73□□□□□ -1.33
CLRN3-201ENST00000368671 CST9LP1Q5W188 147 aa6.73□□□□□ -1.33
CLRN3-201ENST00000368671 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.73□□□□□ -1.33
CLRN3-201ENST00000368671 ENHOQ6UWT2 76 aa6.73□□□□□ -1.33
CLRN3-201ENST00000368671 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.73□□□□□ -1.33
CLRN3-201ENST00000368671 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.73□□□□□ -1.33
CLRN3-201ENST00000368671 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
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CLRN3-201ENST00000368671 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.72□□□□□ -1.33
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CLRN3-201ENST00000368671 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.71□□□□□ -1.34
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CLRN3-201ENST00000368671 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.7□□□□□ -1.34
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CLRN3-201ENST00000368671 SSTP61278 116 aa6.7□□□□□ -1.34
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CLRN3-201ENST00000368671 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.7□□□□□ -1.34
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CLRN3-201ENST00000368671 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.68□□□□□ -1.34
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CLRN3-201ENST00000368671 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.66□□□□□ -1.34
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CLRN3-201ENST00000368671 OR5AL1P0C617 328 aa6.65□□□□□ -1.34
CLRN3-201ENST00000368671 AP1S3Q96PC3 154 aa6.65□□□□□ -1.34
CLRN3-201ENST00000368671 MLST8Q9BVC4 326 aa6.65□□□□□ -1.34
CLRN3-201ENST00000368671 BATF3Q9NR55 127 aa6.65□□□□□ -1.34
CLRN3-201ENST00000368671 PRR34Q9NV39 138 aa6.65□□□□□ -1.34
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CLRN3-201ENST00000368671 GZMBP10144 247 aa6.63□□□□□ -1.35
CLRN3-201ENST00000368671 REG3AQ06141 175 aa6.63□□□□□ -1.35
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CLRN3-201ENST00000368671 hDV102S1A0JD36 115 aa6.62□□□□□ -1.35
CLRN3-201ENST00000368671 UMAD1C9J7I0 102 aa6.62□□□□□ -1.35
CLRN3-201ENST00000368671 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CLRN3-201ENST00000368671 RAB5CP51148 216 aa6.62□□□□□ -1.35
CLRN3-201ENST00000368671 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.62□□□□□ -1.35
CLRN3-201ENST00000368671 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.62□□□□□ -1.35
CLRN3-201ENST00000368671 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.62□□□□□ -1.35
CLRN3-201ENST00000368671 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.62□□□□□ -1.35
CLRN3-201ENST00000368671 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.62□□□□□ -1.35
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