RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368378.7

THBS3-201, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,145 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-201ENST00000368378 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 A0A087WX48 190 aa6.7□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 PRSS2P07478 247 aa6.7□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 P0DMU3 169 aa6.7□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 FAM231AP0DMU4 169 aa6.7□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 FAM231CP0DMU5 169 aa6.7□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.7□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.7□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 ZNF580Q9UK33 172 aa6.7□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 J3QLI3 93 aa6.7□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 AJUBAQ96IF1 538 aa6.7□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 MDFICQ9P1T7 246 aa6.7□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 F8VRH5 84 aa6.7□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 LMO4P61968 165 aa6.7□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 GAGE13Q4V321 117 aa6.7□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.7□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.69□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.69□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 H7C1H1 209 aa6.69□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 IGHV4-39P01824 125 aa6.69□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 BAALCQ8WXS3 180 aa6.69□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 C11orf86A6NJI1 115 aa6.69□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.69□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.68□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.68□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.68□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 SYNJ2BPP57105 145 aa6.68□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 PROK1P58294 105 aa6.68□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.68□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.68□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.68□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.68□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 A8MZ25 164 aa6.68□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 GPHB5Q86YW7 130 aa6.68□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 C3orf56Q8N813 242 aa6.68□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 CNFNQ9BYD5 112 aa6.68□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.67□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.67□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.67□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 AVPP01185 164 aa6.67□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.67□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 SYT8Q8NBV8 401 aa6.67□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 AKAP9Q99996 3911 aa6.67□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 CCDC179H3BU77 68 aa6.67□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.67□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 Q9UF83 564 aa6.67□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.66□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 RBAKDNA6NC62 111 aa6.66□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 IGHV4-59P01825 116 aa6.66□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 KIR2DL4Q99706 377 aa6.66□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 PLNP26678 52 aa6.66□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.66□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.66□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.66□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.66□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 DAND5Q8N907 189 aa6.66□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 CCL19Q99731 98 aa6.66□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 KRTAP10-9P60411 292 aa6.65□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.65□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.65□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 IGHV1-69P01742 117 aa6.65□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 XGP55808 180 aa6.65□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.65□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.65□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 MRAPQ8TCY5 172 aa6.65□□□□□ -1.34
THBS3-201ENST00000368378 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 TMEM89A2RUT3 159 aa6.65□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 RRN3P1Q2M238 152 aa6.65□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 ZNF876PQ49A33 203 aa6.65□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 Q6ZSV7 163 aa6.65□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 Q8N1Y9 231 aa6.64□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 PIFOQ8TCI5 191 aa6.64□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.64□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.64□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 A0A0J9YXV3 536 aa6.64□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 TM2D2Q9BX73 214 aa6.64□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 ZMAT4Q9H898 229 aa6.64□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 V9GYY9 64 aa6.64□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 E9PLD3 99 aa6.63□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.63□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.63□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 CDIP1Q9H305 208 aa6.63□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 F8P00451 2351 aa6.63□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 COX6B1P14854 86 aa6.63□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 Q6ZUT4 128 aa6.63□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 TSHBP01222 138 aa6.63□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 IGHV3-53P01767 116 aa6.63□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
THBS3-201ENST00000368378 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms