RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.22□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 CNFNQ9BYD5 112 aa5.22□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.21□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa5.21□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 K7EP13 123 aa5.21□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.21□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 EVI2AP22794 236 aa5.21□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 TIRAPP58753 221 aa5.21□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 RAB4BP61018 213 aa5.21□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.21□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.21□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.21□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 TSKUQ8WUA8 353 aa5.21□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 ISOC2Q96AB3 205 aa5.21□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 A0A087WWC5 75 aa5.2□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GW15 77 aa5.2□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 TWIST1Q15672 202 aa5.2□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.2□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 NFE4Q86UQ8 179 aa5.2□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 OR10G8Q8NGN5 311 aa5.2□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 FRZBQ92765 325 aa5.2□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.2□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 A0A087WWL8 130 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GUT8 65 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00862A6NCI5 91 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 HIGD1CA8MV81 97 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 F5H697 171 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 CDK2AP2O75956 126 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 MT-ND4LP03901 98 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 S100A8P05109 93 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 CRYGDP07320 174 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 GZMBP10144 247 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP10-2P60368 255 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF56Q15929 161 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 UFSP1Q6NVU6 142 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 NAT8BQ9UHF3 227 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.19□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.18□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.18□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 NTF3P20783 257 aa5.18□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 PKIAP61925 76 aa5.18□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 RIGQ13278 110 aa5.18□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.18□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZSN1 163 aa5.18□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 COMMD7Q86VX2 200 aa5.18□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC30Q96LL9 226 aa5.18□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 SAMD10Q9BYL1 202 aa5.18□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.18□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 JPT2Q9H910 190 aa5.18□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM218A2RU14 115 aa5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 GAGE12JA6NER3 117 aa5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 F8W036 122 aa5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R17O96001 155 aa5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00694P0DN24 101 aa5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 GAGE1Q13065 139 aa5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 GAGE4Q13068 117 aa5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 GAGE5Q13069 117 aa5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFA5Q16718 116 aa5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 GAGE13Q4V321 117 aa5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 LELP1Q5T871 98 aa5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 KCNIP4Q6PIL6 250 aa5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 GTSF1Q8WW33 167 aa5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 SEC11CQ9BY50 192 aa5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 V9GYV3 84 aa5.17□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.16□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 A0A087WTM6 91 aa5.16□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.16□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.16□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa5.16□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3-30P01768 117 aa5.16□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3-33P01772 117 aa5.16□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 MGPP08493 103 aa5.16□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.16□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.16□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 SSTP61278 116 aa5.16□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa5.16□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 CTDSP1Q9GZU7 261 aa5.16□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM191AQ9H0A3 160 aa5.16□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 Q9UF83 564 aa5.16□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.16□□□□□ -1.58
SGMS1-201ENST00000361543 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.15□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 PSCAO43653 123 aa5.15□□□□□ -1.59
SGMS1-201ENST00000361543 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.15□□□□□ -1.59
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