RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV1-8P0DP01 117 aa8.17□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 UBE2E1P51965 193 aa8.17□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRIMA1Q86XR5 153 aa8.17□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.17□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 C11orf86A6NJI1 115 aa8.16□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6ZSV7 163 aa8.16□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM223A0PJW6 202 aa8.16□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.16□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 STHQ8IWL8 128 aa8.16□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 C16orf95Q9H693 158 aa8.16□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.16□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.16□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRGV3P03979 118 aa8.16□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q8TAT8 98 aa8.16□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCL21O00585 134 aa8.15□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 COX6CP09669 75 aa8.15□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.15□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATRXP46100 2492 aa8.14□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.14□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 TEX22C9J3V5 150 aa8.14□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.14□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM243Q9BU79 118 aa8.14□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 COL12A1Q99715 3063 aa8.14□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.14□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV1-17P01599 117 aa8.14□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.14□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.13□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa8.13□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.13□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.13□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.13□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.12□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 LST1O00453 97 aa8.12□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.12□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.12□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.12□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 E7EQL1 145 aa8.12□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.12□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF575Q86XF7 245 aa8.12□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 TOMM6Q96B49 74 aa8.12□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 C20orf173Q96LM9 149 aa8.12□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 SS18Q15532 418 aa8.11□□□□□ -1.11
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APOBEC3C-201ENST00000361441 DCANP1Q8TF63 244 aa8.11□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.11□□□□□ -1.11
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APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.1□□□□□ -1.11
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APOBEC3C-201ENST00000361441 PSMB8P28062 276 aa8.1□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.1□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 COL6A6A6NMZ7 2263 aa8.1□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 I3L3M4 83 aa8.1□□□□□ -1.11
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APOBEC3C-201ENST00000361441 GFRALQ6UXV0 394 aa8.1□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.1□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.1□□□□□ -1.11
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APOBEC3C-201ENST00000361441 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.09□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.09□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q96MF0 132 aa8.09□□□□□ -1.11
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV1-47P01700 117 aa8.08□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.08□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 RNF182Q8N6D2 247 aa8.08□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGF2RP11717 2491 aa8.08□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 NDUFC2O95298 119 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 CNFNQ9BYD5 112 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 H3BRN7 92 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 EPM2AB3EWF7 344 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 NDPQ00604 133 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 PMAIP1Q13794 54 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.07□□□□□ -1.12
APOBEC3C-201ENST00000361441 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
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