RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354662.5

LMO3-204, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,574 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-204ENST00000354662 LEAP2Q969E1 77 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-204ENST00000354662 MED14OSP0DP75 135 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-204ENST00000354662 CCL13Q99616 98 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-204ENST00000354662 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-204ENST00000354662 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-204ENST00000354662 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-204ENST00000354662 Q8TAT8 98 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-204ENST00000354662 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
LMO3-204ENST00000354662 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
LMO3-204ENST00000354662 LAMA3Q16787 3333 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-204ENST00000354662 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-204ENST00000354662 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-204ENST00000354662 IGHV3-9P01782 118 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 BLCAPP62952 87 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 F8WEM9 126 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 Q9UF83 564 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 PRSS33Q8NF86 280 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 ZNF318Q5VUA4 2279 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 TEX22C9J3V5 150 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 Q1T7F1 81 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 C6orf223Q8N319 242 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 NACAE9PAV3 2078 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 ZFHX3Q15911 3703 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 HCP5Q6MZN7 132 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 VCYO14598 125 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 ERC2-IT1O76042 136 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 IGLV1-44P01699 117 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 NAV3Q8IVL0 2385 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 SPINK14Q6IE38 97 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 LINC00315P59091 139 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 ESRGQ1W209 222 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 K7EIM0 57 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 PF4P02776 101 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 MIFP14174 115 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 MAGEA5P43359 124 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 IGKV3-15P01624 115 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 ZNRF1Q8ND25 227 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 SOCS3O14543 225 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 RMI2Q96E14 147 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 U3KQE9 123 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 NDUFB3O43676 98 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 ZNF580Q9UK33 172 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 CTSGP08311 255 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 LENEPQ9Y5L5 61 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 SEC16AO15027 2179 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 PRR14LQ5THK1 2151 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 CEP290O15078 2479 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 FREM1Q5H8C1 2179 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 NDUFA1O15239 70 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 IGF1P05019 195 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 SVILO95425 2214 aa5.96□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 E7EQL1 145 aa5.96□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa5.96□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 M0R1B8 84 aa5.96□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa5.96□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa5.96□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.96□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 HES7Q9BYE0 225 aa5.96□□□□□ -1.45
LMO3-204ENST00000354662 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-204ENST00000354662 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-204ENST00000354662 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-204ENST00000354662 EYSQ5T1H1 3165 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-204ENST00000354662 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-204ENST00000354662 A0A0J9YXV3 536 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-204ENST00000354662 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-204ENST00000354662 PRAC2D3DTV9 90 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-204ENST00000354662 LPAL2Q16609 132 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-204ENST00000354662 ENHOQ6UWT2 76 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-204ENST00000354662 Q6ZTC4 211 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms