RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 OOSP1A8MZH6 123 aa12.57□□□□□ -0.4
GDE1-201ENST00000353258 H7C423 109 aa12.57□□□□□ -0.4
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GDE1-201ENST00000353258 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
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GDE1-201ENST00000353258 UBE2E1P51965 193 aa12.57□□□□□ -0.4
GDE1-201ENST00000353258 DUX3Q96PT4 197 aa12.57□□□□□ -0.4
GDE1-201ENST00000353258 LINC01587Q99440 93 aa12.57□□□□□ -0.4
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GDE1-201ENST00000353258 LINC00315P59091 139 aa12.56□□□□□ -0.4
GDE1-201ENST00000353258 TMEM219Q86XT9 240 aa12.56□□□□□ -0.4
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GDE1-201ENST00000353258 LINC00527Q9UJ94 153 aa12.55□□□□□ -0.4
GDE1-201ENST00000353258 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.55□□□□□ -0.4
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GDE1-201ENST00000353258 SUMO4Q6EEV6 95 aa12.55□□□□□ -0.4
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GDE1-201ENST00000353258 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
GDE1-201ENST00000353258 TMEM126AQ9H061 195 aa12.54□□□□□ -0.4
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GDE1-201ENST00000353258 POM121L12Q8N7R1 296 aa12.54□□□□□ -0.4
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GDE1-201ENST00000353258 CELSR2Q9HCU4 2923 aa12.53□□□□□ -0.4
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GDE1-201ENST00000353258 ID1P41134 155 aa12.53□□□□□ -0.4
GDE1-201ENST00000353258 BRD3OSQ6XYD6 125 aa12.53□□□□□ -0.4
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GDE1-201ENST00000353258 CLEC2BQ92478 149 aa12.52□□□□□ -0.4
GDE1-201ENST00000353258 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.4
GDE1-201ENST00000353258 U3KQE9 123 aa12.51□□□□□ -0.41
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GDE1-201ENST00000353258 IGHV1-69P01742 117 aa12.48□□□□□ -0.41
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GDE1-201ENST00000353258 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa12.48□□□□□ -0.41
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GDE1-201ENST00000353258 CSMD2Q7Z408 3487 aa12.47□□□□□ -0.41
GDE1-201ENST00000353258 OVOL1O14753 267 aa12.47□□□□□ -0.41
GDE1-201ENST00000353258 NPC2P61916 151 aa12.47□□□□□ -0.41
GDE1-201ENST00000353258 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
GDE1-201ENST00000353258 C5orf56Q8N8D9 126 aa12.47□□□□□ -0.41
GDE1-201ENST00000353258 LINC00694P0DN24 101 aa12.47□□□□□ -0.41
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GDE1-201ENST00000353258 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa12.46□□□□□ -0.41
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GDE1-201ENST00000353258 IGSF10Q6WRI0 2623 aa12.45□□□□□ -0.42
GDE1-201ENST00000353258 C9orf153Q5TBE3 101 aa12.45□□□□□ -0.42
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GDE1-201ENST00000353258 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa12.45□□□□□ -0.42
GDE1-201ENST00000353258 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa12.45□□□□□ -0.42
GDE1-201ENST00000353258 MYO18BQ8IUG5 2567 aa12.44□□□□□ -0.42
GDE1-201ENST00000353258 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa12.44□□□□□ -0.42
GDE1-201ENST00000353258 I3L3M4 83 aa12.44□□□□□ -0.42
GDE1-201ENST00000353258 SOCS3O14543 225 aa12.44□□□□□ -0.42
GDE1-201ENST00000353258 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa12.44□□□□□ -0.42
GDE1-201ENST00000353258 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa12.44□□□□□ -0.42
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