RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325103.10

HPS1-201, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-201ENST00000325103 Q6ZVH6 145 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 MUC4Q99102 2169 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 A0A096LNJ9 63 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 LINC01545Q5VT33 79 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 DEFB4AO15263 64 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 PCP2Q8IVA1 136 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 C20orf78Q9BR46 151 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 ZNF575Q86XF7 245 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 GAGE12JA6NER3 117 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 GAGE1Q13065 139 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 GAGE4Q13068 117 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 GAGE5Q13069 117 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 GAGE13Q4V321 117 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 AMTNQ6UX39 209 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 OR11H2Q8NH07 326 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HPS1-201ENST00000325103 A8MWV9 139 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 C3orf56Q8N813 242 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 VCX2Q9H322 139 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 MED14OSP0DP75 135 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 ODF3Q96PU9 254 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 ZFP2Q6ZN57 461 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 Q6ZTI0 123 aa9.52□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 COTL1Q14019 142 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.51□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 I3L3M4 83 aa9.5□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 CRYGDP07320 174 aa9.5□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.5□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 HERVK_113P61574 105 aa9.5□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 C12orf54Q6X4T0 127 aa9.5□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 BAHCC1Q9P281 2608 aa9.5□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 C9orf85Q96MD7 179 aa9.49□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 HIST1H4GQ99525 98 aa9.49□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 A0A096LPF7 62 aa9.49□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 ODF1Q14990 250 aa9.49□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.49□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 C16orf95Q9H693 158 aa9.49□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 SCRT2Q9NQ03 307 aa9.49□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 UBE2L6O14933 153 aa9.48□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 CRLF1O75462 422 aa9.48□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 ZNF479Q96JC4 524 aa9.48□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 K7EMI3 77 aa9.48□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 M0QY20 66 aa9.48□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 DEFB135Q30KP9 77 aa9.48□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 SPXQ9BT56 116 aa9.47□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 A0A087WX48 190 aa9.47□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 F8VRH5 84 aa9.47□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 COX8AP10176 69 aa9.47□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 Q9UF83 564 aa9.47□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 TMEM262E9PQX1 116 aa9.47□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 FHL3Q13643 280 aa9.46□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 RHODO00212 210 aa9.46□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 IGLV1-51P01701 117 aa9.46□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 PLNP26678 52 aa9.46□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.46□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 BAALCQ8WXS3 180 aa9.46□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.46□□□□□ -0.89
HPS1-201ENST00000325103 ZNF815PA8K554 130 aa9.46□□□□□ -0.9
HPS1-201ENST00000325103 NDUFA7O95182 113 aa9.46□□□□□ -0.9
HPS1-201ENST00000325103 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.45□□□□□ -0.9
HPS1-201ENST00000325103 STAB1Q9NY15 2570 aa9.45□□□□□ -0.9
HPS1-201ENST00000325103 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.45□□□□□ -0.9
HPS1-201ENST00000325103 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HPS1-201ENST00000325103 PMVKQ15126 192 aa9.45□□□□□ -0.9
HPS1-201ENST00000325103 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.45□□□□□ -0.9
HPS1-201ENST00000325103 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.45□□□□□ -0.9
HPS1-201ENST00000325103 TOMM6Q96B49 74 aa9.45□□□□□ -0.9
HPS1-201ENST00000325103 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.45□□□□□ -0.9
HPS1-201ENST00000325103 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.45□□□□□ -0.9
HPS1-201ENST00000325103 KRTAP10-3P60369 221 aa9.45□□□□□ -0.9
HPS1-201ENST00000325103 SFTA2Q6UW10 78 aa9.45□□□□□ -0.9
HPS1-201ENST00000325103 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.44□□□□□ -0.9
HPS1-201ENST00000325103 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HPS1-201ENST00000325103 Q6ZSN1 163 aa9.44□□□□□ -0.9
HPS1-201ENST00000325103 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.44□□□□□ -0.9
HPS1-201ENST00000325103 A0A0U1RRA0 63 aa9.44□□□□□ -0.9
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