RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 P0DMU3 169 aa20.65■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 FAM231AP0DMU4 169 aa20.65■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 FAM231CP0DMU5 169 aa20.65■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 DEFB113Q30KQ7 82 aa20.65■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa20.65■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 AMELXQ99217 191 aa20.65■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 EDA2RQ9HAV5 297 aa20.65■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 CELSR2Q9HCU4 2923 aa20.65■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 IGHV3-30P01768 117 aa20.64■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa20.64■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 NDUFA11Q86Y39 141 aa20.64■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 SH2D6Q7Z4S9 175 aa20.63■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa20.63■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 TGFAP01135 160 aa20.63■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 LEPROTO15243 131 aa20.62■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 UBE2D3P61077 147 aa20.62■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 UBE2D2P62837 147 aa20.62■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 TMEM223A0PJW6 202 aa20.62■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 ZNF702PQ9H963 129 aa20.62■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 IGHV4-31P0DP07 118 aa20.61■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 APOMO95445 188 aa20.6■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 CFAP126Q5VTH2 177 aa20.6■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 Q6YL49 198 aa20.6■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 DUX5Q96PT3 197 aa20.6■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 CSPG4Q6UVK1 2322 aa20.59■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 FSHBP01225 129 aa20.58■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa20.58■□□□□ 0.89
UBP1-201ENST00000283628 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa20.58■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 Q5PR19 223 aa20.58■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 ARL17AQ8IVW1 177 aa20.58■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 MTURNQ8N3F0 131 aa20.58■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa20.58■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 GAGE12HA6NDE8 117 aa20.57■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 TMEM238C9JI98 176 aa20.57■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa20.57■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 A8MTW9 85 aa20.57■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 CFC1BP0CG36 223 aa20.57■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 CFC1P0CG37 223 aa20.57■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 SIGMAR1Q99720 223 aa20.57■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 SPATA25Q9BR10 227 aa20.57■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 VCX2Q9H322 139 aa20.57■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 RHODO00212 210 aa20.56■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa20.56■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 CR1P17927 2039 aa20.56■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 RBMY1CP0DJD4 496 aa20.55■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 PSMB2P49721 201 aa20.55■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 C10orf126Q8N4M7 172 aa20.55■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa20.54■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 SCGB1A1P11684 91 aa20.54■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 TRAV2A0A0B4J234 112 aa20.54■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 CRYBA4P53673 196 aa20.54■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa20.54■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa20.54■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 PRO1854Q9UHT4 67 aa20.53■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 KNCNA6PVL3 124 aa20.52■□□□□ 0.88
UBP1-201ENST00000283628 A8MWV9 139 aa20.51■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 DEFB131AP59861 70 aa20.51■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa20.51■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 POLQO75417 2590 aa20.51■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa20.5■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 PTPN13Q12923 2485 aa20.5■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 A0A0J9YXV3 536 aa20.5■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 H3BMM0 161 aa20.5■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 AZU1P20160 251 aa20.5■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 Q96MF0 132 aa20.5■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 PTH2Q96A98 100 aa20.49■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 M0R2P5 195 aa20.49■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 FOXI1Q12951 378 aa20.49■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 SFTA2Q6UW10 78 aa20.49■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 GTSF1LQ9H1H1 148 aa20.49■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 CSMD2Q7Z408 3487 aa20.48■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 SLURP1P55000 103 aa20.48■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 CD28P10747 220 aa20.47■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa20.47■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 INSL3P51460 131 aa20.47■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 ZNF415Q09FC8 603 aa20.47■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 DUX3Q96PT4 197 aa20.47■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 HTN1P15515 57 aa20.46■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 Q8N2B8 174 aa20.46■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 PEMTQ9UBM1 199 aa20.46■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 TCL1BO95988 128 aa20.46■□□□□ 0.87
UBP1-201ENST00000283628 A4D1N5 150 aa20.45■□□□□ 0.86
UBP1-201ENST00000283628 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa20.44■□□□□ 0.86
UBP1-201ENST00000283628 A0A0B4J2C4 111 aa20.44■□□□□ 0.86
UBP1-201ENST00000283628 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
UBP1-201ENST00000283628 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
UBP1-201ENST00000283628 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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