RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 J3KT08 172 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRR-201ENST00000283228 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRR-201ENST00000283228 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 hADV29S1A0JD25 119 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 H3BT86 120 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF876PQ49A33 203 aa8.58□□□□□ -1.04
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PTPRR-201ENST00000283228 C20orf173Q96LM9 149 aa8.58□□□□□ -1.04
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PTPRR-201ENST00000283228 IGHV3-11P01762 117 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 I3L3M4 83 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 ATP6V0E1O15342 81 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRR-201ENST00000283228 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRR-201ENST00000283228 CHD8Q9HCK8 2581 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 PF4V1P10720 104 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 TIMM17AQ99595 171 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 COL12A1Q99715 3063 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 M0R1W7 72 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 UQCRQO14949 82 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRR-201ENST00000283228 LRBAP50851 2863 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRR-201ENST00000283228 A0A0G2JNJ9 132 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 Q9UFV3 132 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 LINC01560Q8TB33 94 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 RNF223E7ERA6 249 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM219Q86XT9 240 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 NPBQ8NG41 125 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 LY6LH3BQJ8 138 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC140Q96MF4 163 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 LST1O00453 97 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRR-201ENST00000283228 TRACP01848 142 aa8.53□□□□□ -1.04
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PTPRR-201ENST00000283228 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 NXPH4O95158 308 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 MUC4Q99102 2169 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 LINC00643Q86TS7 51 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1B0GX51 115 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRR-201ENST00000283228 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRR-201ENST00000283228 DSCR8Q96T75 97 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRR-201ENST00000283228 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 KNCNA6PVL3 124 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 Q9HAA7 133 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 B9A039 149 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 DNAL4O96015 105 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 LY6G5BQ8NDX9 201 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 SPG11Q96JI7 2443 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 TRBV12-3P01733 135 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 MIAQ16674 131 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 Q8N9W7 124 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 COX7CP15954 63 aa8.49□□□□□ -1.05
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