RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 LINC01546A6NGU7 62 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 CFHR3Q02985 330 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 PTH2Q96A98 100 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 ZNF479Q96JC4 524 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.41□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.41□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 Q6ZSN1 163 aa6.41□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 KLLNB2CW77 178 aa6.41□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.41□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.41□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.4□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 LINC01549A6NIU2 74 aa6.4□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 A0A0J9YX75 114 aa6.4□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 KLK9Q2XQG4 91 aa6.4□□□□□ -1.38
GINS1-201ENST00000262460 A0A0J9YXV3 536 aa6.4□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 PLNP26678 52 aa6.4□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 RAX2Q96IS3 184 aa6.4□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.4□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.4□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 SIVA1O15304 175 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 PLA2G2AP14555 144 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 ID1P41134 155 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3-53P01767 116 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 Q6ZSV7 163 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 CR1P17927 2039 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 A0A0U1RRA0 63 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 K7ERU9 68 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 KIR2DL4Q99706 377 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 SPXQ9BT56 116 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 IGIPA6NJ69 53 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 TM2D2Q9BX73 214 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 ZNF702PQ9H963 129 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 XCL2Q9UBD3 114 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 K7EQG2 157 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 M0QY20 66 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 PSMB2P49721 201 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 C20orf78Q9BR46 151 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 DAND5Q8N907 189 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 Q96MF0 132 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 NDUFA7O95182 113 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 E9PLD3 99 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 G3V4G9 280 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 HIGD1BQ9P298 99 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 NDUFS8O00217 210 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 AZU1P20160 251 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 Q5PR19 223 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 A0A096LNT2 108 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 VCYO14598 125 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 PMVKQ15126 192 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 CD28P10747 220 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 COX6B1P14854 86 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 RRN3P1Q2M238 152 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 ATRQ13535 2644 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 A0A1B0GWB2 263 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 A0A0J9YY99 117 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 TSPAN13O95857 204 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 C9orf85Q96MD7 179 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 PRSS2P07478 247 aa6.34□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 ELANEP08246 267 aa6.34□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 LINC01587Q99440 93 aa6.34□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 PDZD2O15018 2839 aa6.34□□□□□ -1.39
GINS1-201ENST00000262460 H3BUA1 57 aa6.34□□□□□ -1.39
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