RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258607.9

CKAP2-201, Transcript of cytoskeleton associated protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CKAP2, Length 3,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2-201ENST00000258607 GAGE4Q13068 117 aa6.72□□□□□ -1.33
CKAP2-201ENST00000258607 GAGE5Q13069 117 aa6.72□□□□□ -1.33
CKAP2-201ENST00000258607 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
CKAP2-201ENST00000258607 GAGE13Q4V321 117 aa6.72□□□□□ -1.33
CKAP2-201ENST00000258607 SPXQ9BT56 116 aa6.72□□□□□ -1.33
CKAP2-201ENST00000258607 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.72□□□□□ -1.33
CKAP2-201ENST00000258607 TENM2Q9NT68 2774 aa6.71□□□□□ -1.33
CKAP2-201ENST00000258607 PET117Q6UWS5 81 aa6.71□□□□□ -1.33
CKAP2-201ENST00000258607 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.71□□□□□ -1.33
CKAP2-201ENST00000258607 HIST1H4GQ99525 98 aa6.71□□□□□ -1.33
CKAP2-201ENST00000258607 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
CKAP2-201ENST00000258607 PEMTQ9UBM1 199 aa6.71□□□□□ -1.33
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CKAP2-201ENST00000258607 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
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CKAP2-201ENST00000258607 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.7□□□□□ -1.34
CKAP2-201ENST00000258607 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.7□□□□□ -1.34
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CKAP2-201ENST00000258607 Q8N8P6 123 aa6.69□□□□□ -1.34
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CKAP2-201ENST00000258607 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.66□□□□□ -1.34
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CKAP2-201ENST00000258607 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.65□□□□□ -1.35
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CKAP2-201ENST00000258607 ATP6V0BQ99437 205 aa6.65□□□□□ -1.35
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CKAP2-201ENST00000258607 FGF6P10767 208 aa6.64□□□□□ -1.35
CKAP2-201ENST00000258607 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CKAP2-201ENST00000258607 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.63□□□□□ -1.35
CKAP2-201ENST00000258607 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.63□□□□□ -1.35
CKAP2-201ENST00000258607 MRAPQ8TCY5 172 aa6.63□□□□□ -1.35
CKAP2-201ENST00000258607 GAGE10A6NGK3 116 aa6.63□□□□□ -1.35
CKAP2-201ENST00000258607 VCYO14598 125 aa6.63□□□□□ -1.35
CKAP2-201ENST00000258607 CRLF1O75462 422 aa6.63□□□□□ -1.35
CKAP2-201ENST00000258607 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.63□□□□□ -1.35
CKAP2-201ENST00000258607 GAGE6Q13070 117 aa6.63□□□□□ -1.35
CKAP2-201ENST00000258607 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.63□□□□□ -1.35
CKAP2-201ENST00000258607 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.63□□□□□ -1.35
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