RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 OOSP1A8MZH6 123 aa15.86■□□□□ 0.13
ODC1-201ENST00000234111 DEFB121Q5J5C9 76 aa15.86■□□□□ 0.13
ODC1-201ENST00000234111 COX6CP09669 75 aa15.85■□□□□ 0.13
ODC1-201ENST00000234111 A0A0J9YX75 114 aa15.85■□□□□ 0.13
ODC1-201ENST00000234111 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa15.85■□□□□ 0.13
ODC1-201ENST00000234111 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa15.85■□□□□ 0.13
ODC1-201ENST00000234111 NXPH4O95158 308 aa15.85■□□□□ 0.13
ODC1-201ENST00000234111 NRGNQ92686 78 aa15.85■□□□□ 0.13
ODC1-201ENST00000234111 B9A039 149 aa15.84■□□□□ 0.13
ODC1-201ENST00000234111 NBL1P41271 181 aa15.84■□□□□ 0.13
ODC1-201ENST00000234111 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa15.84■□□□□ 0.13
ODC1-201ENST00000234111 C9orf153Q5TBE3 101 aa15.84■□□□□ 0.13
ODC1-201ENST00000234111 LST1O00453 97 aa15.84■□□□□ 0.13
ODC1-201ENST00000234111 IGHV1-69P01742 117 aa15.84■□□□□ 0.13
ODC1-201ENST00000234111 FAM74A4Q5TZK3 123 aa15.84■□□□□ 0.13
ODC1-201ENST00000234111 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
ODC1-201ENST00000234111 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa15.83■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa15.83■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 SPXQ9BT56 116 aa15.83■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa15.82■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 DNAJC30Q96LL9 226 aa15.82■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 I3L3M4 83 aa15.81■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 OVOL1O14753 267 aa15.81■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 NDUFA7O95182 113 aa15.81■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 CHD8Q9HCK8 2581 aa15.81■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 ATP5J2P56134 94 aa15.81■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 C3orf22Q8N5N4 141 aa15.8■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 FAM19A4Q96LR4 140 aa15.8■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 LINC00527Q9UJ94 153 aa15.8■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa15.79■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 SMCR5Q8TEV8 140 aa15.79■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 M0R1W7 72 aa15.79■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 TIMM21Q9BVV7 248 aa15.79■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 LY6DQ14210 128 aa15.78■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa15.78■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 IGFL3Q6UXB1 125 aa15.78■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 HERVK_113P63121 156 aa15.78■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 ZFHX3Q15911 3703 aa15.77■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa15.77■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa15.77■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa15.77■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 SOCS3O14543 225 aa15.77■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 NPFFO15130 113 aa15.77■□□□□ 0.12
ODC1-201ENST00000234111 RPL11P62913 178 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa15.77■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 IMUPQ9GZP8 106 aa15.77■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 MED13LQ71F56 2210 aa15.77■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 APRG1Q8IVJ8 170 aa15.76■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 SPTA1P02549 2419 aa15.76■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 RHOHQ15669 191 aa15.75■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 TMEM61Q8N0U2 210 aa15.75■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 C20orf203Q8NBC4 194 aa15.75■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 SPANXDQ9BXN6 97 aa15.75■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 SPANXCQ9NY87 97 aa15.75■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 A8MZ25 164 aa15.75■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 MIAQ16674 131 aa15.75■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 KLK9Q2XQG4 91 aa15.75■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 NDUFA12Q9UI09 145 aa15.75■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 KLK9Q9UKQ9 250 aa15.75■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 NCOR2Q9Y618 2525 aa15.75■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 UQCRQO14949 82 aa15.74■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 DUX5Q96PT3 197 aa15.74■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 M0QY20 66 aa15.73■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 NBASA2RRP1 2371 aa15.72■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 MINOS1Q5TGZ0 78 aa15.72■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 LINC00526Q96FQ7 95 aa15.72■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 ACYP1P07311 99 aa15.71■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 C5orf47Q569G3 176 aa15.71■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 DAND5Q8N907 189 aa15.71■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 TRBV12-3P01733 135 aa15.71■□□□□ 0.11
ODC1-201ENST00000234111 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa15.71■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa15.7■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 ATRXP46100 2492 aa15.7■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa15.7■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa15.7■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 LINC00643Q86TS7 51 aa15.7■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 DCANP1Q8TF63 244 aa15.7■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 CD28P10747 220 aa15.69■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 KLLNB2CW77 178 aa15.68■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 J3KT08 172 aa15.68■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 LINC01560Q8TB33 94 aa15.68■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 SMIM9A6NGZ8 99 aa15.68■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 TRAV41A0A0B4J266 112 aa15.67■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 FAM104AQ969W3 186 aa15.67■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa15.66■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 VSIG2Q96IQ7 327 aa15.65■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
ODC1-201ENST00000234111 PIEZO1Q92508 2521 aa15.64■□□□□ 0.09
ODC1-201ENST00000234111 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
ODC1-201ENST00000234111 COX7CP15954 63 aa15.63■□□□□ 0.09
ODC1-201ENST00000234111 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
ODC1-201ENST00000234111 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.9 ms