RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 ENHOQ6UWT2 76 aa17.64■□□□□ 0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB24Q969Q5 203 aa17.64■□□□□ 0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa17.64■□□□□ 0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa17.64■□□□□ 0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 M0R036 132 aa17.63■□□□□ 0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 SSNA1O43805 119 aa17.63■□□□□ 0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 ARMS2P0C7Q2 107 aa17.63■□□□□ 0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 GRIFINA4D1Z8 144 aa17.62■□□□□ 0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 ANGP03950 147 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM167BQ9NRX6 74 aa17.62■□□□□ 0.41
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CAPNS1-217ENST00000629983 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa17.61■□□□□ 0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 M0R381 172 aa17.61■□□□□ 0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa17.61■□□□□ 0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 SUN5Q8TC36 379 aa17.61■□□□□ 0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa17.61■□□□□ 0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS1P07477 247 aa17.6■□□□□ 0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2D3P61077 147 aa17.6■□□□□ 0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2D2P62837 147 aa17.6■□□□□ 0.41
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CAPNS1-217ENST00000629983 MPV17L2Q567V2 206 aa17.59■□□□□ 0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZRU5 148 aa17.59■□□□□ 0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF213Q63HN8 5207 aa17.59■□□□□ 0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa17.58■□□□□ 0.4
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CAPNS1-217ENST00000629983 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa17.58■□□□□ 0.4
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf163Q8N9P6 203 aa17.58■□□□□ 0.4
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CAPNS1-217ENST00000629983 KRBOX1C9JBD0 128 aa17.57■□□□□ 0.4
CAPNS1-217ENST00000629983 Q86TA4 180 aa17.57■□□□□ 0.4
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CAPNS1-217ENST00000629983 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa17.55■□□□□ 0.4
CAPNS1-217ENST00000629983 SH2D1AO60880 128 aa17.54■□□□□ 0.4
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CAPNS1-217ENST00000629983 MBP02144 154 aa17.54■□□□□ 0.4
CAPNS1-217ENST00000629983 MIAQ16674 131 aa17.54■□□□□ 0.4
CAPNS1-217ENST00000629983 DNLZQ5SXM8 178 aa17.54■□□□□ 0.4
CAPNS1-217ENST00000629983 CLPSL2Q6UWE3 100 aa17.54■□□□□ 0.4
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFP82Q8N141 532 aa17.54■□□□□ 0.4
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
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CAPNS1-217ENST00000629983 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
CAPNS1-217ENST00000629983 DPH3Q96FX2 82 aa17.53■□□□□ 0.4
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PRE2 83 aa17.52■□□□□ 0.4
CAPNS1-217ENST00000629983 PEX7O00628 323 aa17.52■□□□□ 0.4
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2G2P60604 165 aa17.52■□□□□ 0.4
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CAPNS1-217ENST00000629983 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
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CAPNS1-217ENST00000629983 UPK1BO75841 260 aa17.49■□□□□ 0.39
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10G8Q8NGN5 311 aa17.49■□□□□ 0.39
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFA13Q9P0J0 144 aa17.49■□□□□ 0.39
CAPNS1-217ENST00000629983 SERF2P84101 59 aa17.48■□□□□ 0.39
CAPNS1-217ENST00000629983 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa17.48■□□□□ 0.39
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CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2G1P62253 170 aa17.45■□□□□ 0.38
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CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00269Q8N2A0 174 aa17.45■□□□□ 0.38
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H2BAQ96A08 127 aa17.45■□□□□ 0.38
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFSF18Q9UNG2 199 aa17.45■□□□□ 0.38
CAPNS1-217ENST00000629983 RBX1P62877 108 aa17.44■□□□□ 0.38
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CAPNS1-217ENST00000629983 hDV102S1A0JD36 115 aa17.43■□□□□ 0.38
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CAPNS1-217ENST00000629983 AP5S1Q9NUS5 200 aa17.41■□□□□ 0.38
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CAPNS1-217ENST00000629983 F5H697 171 aa17.4■□□□□ 0.38
CAPNS1-217ENST00000629983 CHTF8P0CG12 524 aa17.4■□□□□ 0.38
CAPNS1-217ENST00000629983 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF674Q2M3X9 581 aa17.4■□□□□ 0.38
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa17.4■□□□□ 0.38
CAPNS1-217ENST00000629983 COX8CQ7Z4L0 72 aa17.4■□□□□ 0.38
CAPNS1-217ENST00000629983 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A087WYN8 130 aa17.39■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa17.39■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 A6NHS1 94 aa17.39■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 CNBPP62633 177 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR27Q6MZM9 219 aa17.39■□□□□ 0.37
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