RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623635.1

PTPRQ-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRQ, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-210ENST00000623635 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa1.27□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 S100A1P23297 94 aa1.27□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 NPC2P61916 151 aa1.27□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.27□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 ZNF462Q96JM2 2506 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 LINC00587B1AMM8 73 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 TSC22D3Q99576 134 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 BET1LQ9NYM9 111 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 NOTCH1P46531 2555 aa1.26□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 MRC2Q9UBG0 1479 aa1.25□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 SLC48A1Q6P1K1 146 aa1.25□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa1.25□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa1.25□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 C1orf54Q8WWF1 131 aa1.25□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 DPH3Q96FX2 82 aa1.25□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 C2orf88Q9BSF0 95 aa1.25□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 COA4Q9NYJ1 87 aa1.25□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 LAMB1P07942 1786 aa1.25□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 FAM135AQ9P2D6 1515 aa1.25□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 LOC285556D6RIA3 1793 aa1.24□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa1.24□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 SELENOWP63302 87 aa1.24□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 EMX2Q04743 252 aa1.24□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa1.24□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 KCNRGQ8N5I3 272 aa1.24□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 CCDC167Q9P0B6 97 aa1.24□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 CCNB3Q8WWL7 1395 aa1.23□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 LINC00470Q9BZP3 86 aa1.23□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 TMEM242Q9NWH2 141 aa1.23□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 CNTLNQ9NXG0 1405 aa1.23□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 A0A1B0GV90 55 aa1.22□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 DLEU1O43261 78 aa1.22□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 CCL3L1P16619 93 aa1.22□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa1.22□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.21
PTPRQ-210ENST00000623635 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 IFNGP01579 166 aa1.21□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 IL5P05113 134 aa1.21□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa1.21□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 ARL11Q969Q4 196 aa1.21□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 DSCR8Q96T75 97 aa1.21□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 VPS8Q8N3P4 1428 aa1.21□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 ABCA1O95477 2261 aa1.2□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 NALCNQ8IZF0 1738 aa1.2□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 A0A087WTM6 91 aa1.19□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 SMIM6P0DI80 62 aa1.19□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 PIPP12273 146 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 S100PP25815 95 aa1.19□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 SPATA8Q6RVD6 105 aa1.19□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 TMEM203Q969S6 136 aa1.19□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 SPTSSAQ969W0 71 aa1.19□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 DAPK1P53355 1430 aa1.18□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 RBAKDNA6NC62 111 aa1.18□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa1.18□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 GNG7O60262 68 aa1.18□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 NDUFB6O95139 128 aa1.18□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 UBE2G1P62253 170 aa1.18□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 C20orf197Q8N268 126 aa1.18□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 C12orf57Q99622 126 aa1.18□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 MBD5Q9P267 1494 aa1.18□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 PHLPP1O60346 1717 aa1.18□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 FAM25AB3EWG3 89 aa1.17□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 FAM25CB3EWG5 89 aa1.17□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 FAM25GB3EWG6 89 aa1.17□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 C10orf82Q8WW14 230 aa1.17□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 TCEAL7Q9BRU2 100 aa1.17□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 RPRMQ9NS64 109 aa1.17□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 TANC1Q9C0D5 1861 aa1.17□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP1.17□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 MED13LQ71F56 2210 aa1.16□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 COX7B2Q8TF08 81 aa1.16□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 C14orf144Q96I85 54 aa1.16□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 SPEF2Q9C093 1822 aa1.16□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 NRXN2Q9P2S2 1712 aa1.15□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 PHIPQ8WWQ0 1821 aa1.15□□□□□ -2.22
PTPRQ-210ENST00000623635 FAM92AA1XBS5 289 aa1.15□□□□□ -2.23
PTPRQ-210ENST00000623635 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa1.15□□□□□ -2.23
PTPRQ-210ENST00000623635 FOCADQ5VW36 1801 aa1.15□□□□□ -2.23
PTPRQ-210ENST00000623635 QRICH2Q9H0J4 1663 aa1.14□□□□□ -2.23
PTPRQ-210ENST00000623635 MCRIP1C9JLW8 97 aa1.14□□□□□ -2.23
PTPRQ-210ENST00000623635 APODP05090 189 aa1.14□□□□□ -2.23
PTPRQ-210ENST00000623635 CBLN1P23435 193 aa1.14□□□□□ -2.23
PTPRQ-210ENST00000623635 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
PTPRQ-210ENST00000623635 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa1.14□□□□□ -2.23
PTPRQ-210ENST00000623635 ZNF609O15014 1411 aa1.14□□□□□ -2.23
PTPRQ-210ENST00000623635 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
PTPRQ-210ENST00000623635 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
PTPRQ-210ENST00000623635 TTC37Q6PGP7 1564 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRQ-210ENST00000623635 A2ML1A8K2U0 1454 aa1.13□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms