RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 M0R036 132 aa14.66□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 ARMS2P0C7Q2 107 aa14.66□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 UBE2G1P62253 170 aa14.66□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 ZNF345Q14585 488 aa14.66□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 Q8N3U1 123 aa14.66□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRRT-218ENST00000620394 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.65□□□□□ -0.06
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SRRT-218ENST00000620394 STOML3Q8TAV4 291 aa14.64□□□□□ -0.07
SRRT-218ENST00000620394 DNAH8Q96JB1 4490 aa14.64□□□□□ -0.07
SRRT-218ENST00000620394 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SRRT-218ENST00000620394 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SRRT-218ENST00000620394 AKR1C3P42330 323 aa14.63□□□□□ -0.07
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SRRT-218ENST00000620394 TM2D2Q9BX73 214 aa14.63□□□□□ -0.07
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SRRT-218ENST00000620394 CST9LP1Q5W188 147 aa14.62□□□□□ -0.07
SRRT-218ENST00000620394 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa14.62□□□□□ -0.07
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SRRT-218ENST00000620394 ZFP82Q8N141 532 aa14.6□□□□□ -0.07
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SRRT-218ENST00000620394 A0A087WWL8 130 aa14.59□□□□□ -0.07
SRRT-218ENST00000620394 UMAD1C9J7I0 102 aa14.59□□□□□ -0.07
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SRRT-218ENST00000620394 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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SRRT-218ENST00000620394 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa14.58□□□□□ -0.08
SRRT-218ENST00000620394 HMSDA8MTL9 139 aa14.58□□□□□ -0.08
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SRRT-218ENST00000620394 CXCL1P09341 107 aa14.58□□□□□ -0.08
SRRT-218ENST00000620394 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa14.58□□□□□ -0.08
SRRT-218ENST00000620394 S100A9P06702 114 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SRRT-218ENST00000620394 NIT1Q86X76 327 aa14.57□□□□□ -0.08
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SRRT-218ENST00000620394 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.56□□□□□ -0.08
SRRT-218ENST00000620394 MLST8Q9BVC4 326 aa14.56□□□□□ -0.08
SRRT-218ENST00000620394 FAM30AQ9NZY2 134 aa14.56□□□□□ -0.08
SRRT-218ENST00000620394 SCO2A0A1W2PP80 73 aa14.55□□□□□ -0.08
SRRT-218ENST00000620394 BCL2L11O43521 198 aa14.55□□□□□ -0.08
SRRT-218ENST00000620394 LINC00528Q8N1L1 170 aa14.55□□□□□ -0.08
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SRRT-218ENST00000620394 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa14.53□□□□□ -0.08
SRRT-218ENST00000620394 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.52□□□□□ -0.09
SRRT-218ENST00000620394 SNAI2O43623 268 aa14.52□□□□□ -0.09
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SRRT-218ENST00000620394 OR10AG1Q8NH19 301 aa14.52□□□□□ -0.09
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SRRT-218ENST00000620394 PRR27Q6MZM9 219 aa14.51□□□□□ -0.09
SRRT-218ENST00000620394 ATRAIDQ6UW56 229 aa14.51□□□□□ -0.09
SRRT-218ENST00000620394 A0A1B0GV50 99 aa14.5□□□□□ -0.09
SRRT-218ENST00000620394 OR5AL1P0C617 328 aa14.5□□□□□ -0.09
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SRRT-218ENST00000620394 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
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SRRT-218ENST00000620394 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa14.48□□□□□ -0.09
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SRRT-218ENST00000620394 C11orf52Q96A22 123 aa14.48□□□□□ -0.09
SRRT-218ENST00000620394 HMCN2Q8NDA2 5059 aa14.48□□□□□ -0.09
SRRT-218ENST00000620394 A0A087WX48 190 aa14.47□□□□□ -0.09
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SRRT-218ENST00000620394 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa14.46□□□□□ -0.09
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SRRT-218ENST00000620394 RPL35P42766 123 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
SRRT-218ENST00000620394 Q8N976 141 aa14.45□□□□□ -0.1
SRRT-218ENST00000620394 UBE2WQ96B02 151 aa14.45□□□□□ -0.1
SRRT-218ENST00000620394 Q0VG73 95 aa14.44□□□□□ -0.1
SRRT-218ENST00000620394 KCNIP4Q6PIL6 250 aa14.44□□□□□ -0.1
SRRT-218ENST00000620394 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa14.44□□□□□ -0.1
SRRT-218ENST00000620394 UBR4Q5T4S7 5183 aa14.43□□□□□ -0.1
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