RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615442.1

PVT1-223, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 165 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-223	ENST00000615442	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-223	ENST00000615442	SST	P61278	116 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-223	ENST00000615442	BORCS7	Q96B45	105 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-223	ENST00000615442	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-223	ENST00000615442	AP1S3	Q96PC3	154 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-223	ENST00000615442	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-223	ENST00000615442	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-223	ENST00000615442	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-223	ENST00000615442		A0A087WWL8	130 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	TRGC1	P0CF51	173 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	SMIM17	P0DL12	118 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	TWIST1	Q15672	202 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	RNF212	Q495C1	297 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442		A0A1B0GUT8	65 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	NUDT3	O95989	172 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	RAB4B	P61018	213 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	RHOH	Q15669	191 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	NDUFA5	Q16718	116 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442		Q6ZSN1	163 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	NUP35	Q8NFH5	326 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442		P0DMU3	169 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	FAM231A	P0DMU4	169 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	FAM231C	P0DMU5	169 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	GYPE	P15421	78 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	EVI2A	P22794	236 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	LINC00315	P59091	139 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	RIG	Q13278	110 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	IMMP2L	Q96T52	175 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	MUC4	Q99102	2169 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442		A0A096LPF7	62 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442		A0A1B0GW15	77 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442		F5H697	171 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442		K7EQD1	137 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	SRI	P30626	198 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	CCL18	P55774	89 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	RHEB	Q15382	184 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	ZNF56	Q15929	161 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	SVBP	Q8N300	66 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442		A0A087WWC5	75 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	LCE6A	A0A183	80 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442		H7C1H1	209 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	SNAPIN	O95295	136 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	APOC3	P02656	99 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	S100A8	P05109	93 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	MGP	P08493	103 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	FRZB	Q92765	325 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PVT1-223	ENST00000615442		M0QY20	66 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	LY6G6C	O95867	125 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	ESRG	Q1W209	222 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442		A0A1B0GXF2	115 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	GAGE12J	A6NER3	117 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	LINC00694	P0DN24	101 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	TIRAP	P58753	221 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	HBB	P68871	147 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	GAGE1	Q13065	139 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	GAGE4	Q13068	117 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	GAGE5	Q13069	117 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	GAGE13	Q4V321	117 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	BTF3L4	Q96K17	158 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442		Q9UF83	564 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	RAB4A	P20338	218 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PVT1-223	ENST00000615442	S100P	P25815	95 aa		7.25	□□□□□ -1.25

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