RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613271.4

VWCE-208, Transcript of von Willebrand factor C and EGF domains, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene VWCE, Length 3,032 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCE-208ENST00000613271 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.08□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.08□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 TIMD4Q96H15 378 aa9.08□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 MUC4Q99102 2169 aa9.08□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 TMEM262E9PQX1 116 aa9.07□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 J3QQQ9 107 aa9.07□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 ATP6V0E1O15342 81 aa9.07□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 PRSS2P07478 247 aa9.07□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 HERVK_113P61574 105 aa9.07□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 GPHB5Q86YW7 130 aa9.07□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 CCDC140Q96MF4 163 aa9.07□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 IFITM1P13164 125 aa9.07□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.07□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 IGHV3-33P01772 117 aa9.06□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 ASIPP42127 132 aa9.06□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.06□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 METTL26Q96S19 204 aa9.06□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 VCX2Q9H322 139 aa9.06□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 ATRXP46100 2492 aa9.06□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 RBAKDNA6NC62 111 aa9.06□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 PMVKQ15126 192 aa9.06□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 VMO1Q7Z5L0 202 aa9.06□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 DUX3Q96PT4 197 aa9.06□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.05□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.05□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 ODF3Q96PU9 254 aa9.05□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.05□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.963e-7■■■□□ 16.7
VWCE-208ENST00000613271 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.05□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 IGIPA6NJ69 53 aa9.05□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.05□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 PIP4P1Q86T03 277 aa9.05□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 VPS13CQ709C8 3753 aa9.04□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 CD3EP07766 207 aa9.04□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 Q8N9W7 124 aa9.04□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 AMELXQ99217 191 aa9.04□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 TRBV12-3P01733 135 aa9.04□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 LINC01620Q4KN68 170 aa9.04□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.04□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 ZNF56Q15929 161 aa9.03□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.03□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 TMEM219Q86XT9 240 aa9.03□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 B9A039 149 aa9.03□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 IGKV3-20P01619 116 aa9.03□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa9.02□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.02□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.02□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 CLEC2BQ92478 149 aa9.02□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 LINC00477Q96M19 166 aa9.02□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 SPXQ9BT56 116 aa9.02□□□□□ -0.96
VWCE-208ENST00000613271 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa9.02□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.02□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 A0A0J9YXV3 536 aa9.02□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 A8MZ25 164 aa9.02□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 TRIAP1O43715 76 aa9.02□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.02□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 IGHV3-11P01762 117 aa9.02□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 C2orf82Q6UX34 121 aa9.01□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 LY6G5BQ8NDX9 201 aa9.01□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 IGF2RP11717 2491 aa9□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 ODF3BA8MYP8 253 aa9□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 FOXC1Q12948 553 aa9□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 EDN2P20800 178 aa8.99□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 UBE2E1P51965 193 aa8.99□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 LINC00315P59091 139 aa8.99□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 ATXN8Q156A1 80 aa8.99□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 DAND5Q8N907 189 aa8.99□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 C2CD3Q4AC94 2353 aa8.99□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 NACAE9PAV3 2078 aa8.99□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.99□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.99□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 ZNF876PQ49A33 203 aa8.99□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 Q8N6K4 173 aa8.99□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 H3BMM0 161 aa8.99□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 BRI3O95415 125 aa8.99□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 UBE2WQ96B02 151 aa8.99□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.98□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 VCYO14598 125 aa8.98□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.98□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.98□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 SPG11Q96JI7 2443 aa8.98□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.98□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.97□□□□□ -0.97
VWCE-208ENST00000613271 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.1 ms