RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	RHOD	O00212	210 aa		7.74	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	CRIP1	P50238	77 aa		7.74	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		7.74	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		7.74	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	CXorf1	O96002	111 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF726P1	Q15940	193 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338		Q6ZNX1	250 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A087WX48	190 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PRE2	83 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	PEX7	O00628	323 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	SH2D1A	O60880	128 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2D3	P61077	147 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2D2	P62837	147 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	SFRP2	Q96HF1	295 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TTLL3-233	ENST00000602338		M0R381	172 aa		7.71	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	PFDN1	O60925	122 aa		7.71	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	SEC11B	P0C7V7	166 aa		7.71	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2G2	P60604	165 aa		7.71	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ENHO	Q6UWT2	76 aa		7.71	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	AQP10	Q96PS8	301 aa		7.71	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	USP17L23	D6RBM5	183 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	PANO1	I0J062	215 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	IFNA7	P01567	189 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	MB	P02144	154 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	SERF2	P84101	59 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	MPV17L2	Q567V2	206 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM74A7	A6NL05	159 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	HLA-DQA1	P01909	254 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	MT1HL1	P0DM35	61 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338		Q0VG73	95 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ELOB	Q15370	118 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338		Q5BKY6	102 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ALG5	Q9Y673	324 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	7.69	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	PRSS1	P07477	247 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC01559	Q495D7	138 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	C14orf177	Q52M58	125 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFP82	Q8N141	532 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	TNXB	P22105	4242 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM262	E9PQX1	116 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	CRP	P02741	224 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	DEFA1	P59665	94 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	DEFA3	P59666	94 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	PTTG1	O95997	202 aa		7.66	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	PRR27	Q6MZM9	219 aa		7.66	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		7.66	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		7.66	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		7.66	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		7.66	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	LRP2	P98164	4655 aa		7.66	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	LTA	P01374	205 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF56	Q15929	161 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	FMC1	Q96HJ9	113 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB4B	P61018	213 aa		7.64	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2G1	P62253	170 aa		7.64	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	MIA	Q16674	131 aa		7.64	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		7.64	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	7.64	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	PRR34	Q9NV39	138 aa		7.64	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		7.63	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		7.63	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		7.63	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		7.63	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		7.63	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		7.63	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		7.63	□□□□□ -1.19

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