RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597047.1

ZNF548-206, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 3

Gene ZNF548, Length 682 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-206ENST00000597047 GTSF1Q8WW33 167 aa6.56□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 A0A096LPF7 62 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 HIGD1CA8MV81 97 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 A8MWV9 139 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 PAX4O43316 350 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 SNAI2O43623 268 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 OR5AL1P0C617 328 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 MED14OSP0DP75 135 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 FHL2Q14192 279 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 ZNF56Q15929 161 aa6.55□□□□□ -1.36
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ZNF548-206ENST00000597047 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.55□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 CT83Q5H943 113 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 NUP35Q8NFH5 326 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.54□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 TRGC1P0CF51 173 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 CAMPP49913 170 aa6.53□□□□□ -1.36
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ZNF548-206ENST00000597047 ELOBQ15370 118 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 PTH2Q96A98 100 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 AP1S3Q96PC3 154 aa6.53□□□□□ -1.36
ZNF548-206ENST00000597047 IMMP2LQ96T52 175 aa6.53□□□□□ -1.36
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ZNF548-206ENST00000597047 CRYBA4P53673 196 aa6.52□□□□□ -1.37
ZNF548-206ENST00000597047 SLAQ13239 276 aa6.52□□□□□ -1.37
ZNF548-206ENST00000597047 Q6ZSN1 163 aa6.52□□□□□ -1.37
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ZNF548-206ENST00000597047 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.52□□□□□ -1.37
ZNF548-206ENST00000597047 BTF3L4Q96K17 158 aa6.52□□□□□ -1.37
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ZNF548-206ENST00000597047 GAGE12JA6NER3 117 aa6.51□□□□□ -1.37
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ZNF548-206ENST00000597047 FAM231CP0DMU5 169 aa6.51□□□□□ -1.37
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ZNF548-206ENST00000597047 GAGE5Q13069 117 aa6.51□□□□□ -1.37
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ZNF548-206ENST00000597047 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.5□□□□□ -1.37
ZNF548-206ENST00000597047 WDR73Q6P4I2 378 aa6.5□□□□□ -1.37
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ZNF548-206ENST00000597047 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.5□□□□□ -1.37
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ZNF548-206ENST00000597047 RAB5AP20339 215 aa6.48□□□□□ -1.37
ZNF548-206ENST00000597047 HBBP68871 147 aa6.48□□□□□ -1.37
ZNF548-206ENST00000597047 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.48□□□□□ -1.37
ZNF548-206ENST00000597047 AMN1Q8IY45 258 aa6.48□□□□□ -1.37
ZNF548-206ENST00000597047 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.48□□□□□ -1.37
ZNF548-206ENST00000597047 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.48□□□□□ -1.37
ZNF548-206ENST00000597047 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.48□□□□□ -1.37
ZNF548-206ENST00000597047 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.48□□□□□ -1.37
ZNF548-206ENST00000597047 RYR3Q15413 4870 aa6.47□□□□□ -1.37
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