RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591579.5

NEDD4L-232, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 144 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-232ENST00000591579 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.43□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.42□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 M0R381 172 aa8.42□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.42□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.41□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.41□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.41□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 MT1HL1P0DM35 61 aa8.41□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 ENHOQ6UWT2 76 aa8.41□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 Q86TA4 180 aa8.41□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.41□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.41□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 CXorf1O96002 111 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 PRSS1P07477 247 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 UBE2D3P61077 147 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 UBE2D2P62837 147 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 MPV17L2Q567V2 206 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 SUN5Q8TC36 379 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.4□□□□□ -1.06
NEDD4L-232ENST00000591579 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 KRBOX1C9JBD0 128 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 PANO1I0J062 215 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 IFNA7P01567 189 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 SFRP2Q96HF1 295 aa8.39□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 RNF213Q63HN8 5207 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 PEX7O00628 323 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 SH2D1AO60880 128 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 PTTG1O95997 202 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.38□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 A0A0D9SG52 128 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 UPK1BO75841 260 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 MBP02144 154 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 ATP6V0CP27449 155 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 CRIP1P50238 77 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 UBE2G2P60604 165 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF56Q15929 161 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 Q6ZRU5 148 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 ZFP82Q8N141 532 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.37□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 A0A1W2PRE2 83 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 MIAQ16674 131 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 DNLZQ5SXM8 178 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 S100ZQ8WXG8 99 aa8.36□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 MARVELD1Q9BSK0 173 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.35□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 PKIAP61925 76 aa8.34□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 SERF2P84101 59 aa8.34□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 IFITM3Q01628 133 aa8.34□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.34□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.34□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.34□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 DPH3Q96FX2 82 aa8.34□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 LRP2P98164 4655 aa8.34□□□□□ -1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 RAB4BP61018 213 aa8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 UBE2G1P62253 170 aa8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 RBX1P62877 108 aa8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 GAGE6Q13070 117 aa8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 LINC01559Q495D7 138 aa8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.33□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 hDV102S1A0JD36 115 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 CHTF8P0CG12 524 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 FMC1Q96HJ9 113 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.32□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 FAM74A7A6NL05 159 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 F5H697 171 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 DEFA3P59666 94 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF726P1Q15940 193 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 AQP10Q96PS8 301 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 PRR34Q9NV39 138 aa8.31□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 PRR27Q6MZM9 219 aa8.3□□□□□ -1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.2 ms