RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-223	ENST00000577256		K7EP13	123 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ATG13-223	ENST00000577256	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
ATG13-223	ENST00000577256	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ATG13-223	ENST00000577256	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ATG13-223	ENST00000577256	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM250	H0YL14	139 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	CRYGD	P07320	174 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	XKRY2	A2RUG3	117 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256		P01737	135 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	EVI2A	P22794	236 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	TNP2	Q05952	138 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	GAGE12J	A6NER3	117 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	LINC00694	P0DN24	101 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	LINC00315	P59091	139 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	GAGE1	Q13065	139 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	GAGE4	Q13068	117 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	GAGE5	Q13069	117 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	GAGE13	Q4V321	117 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	LELP1	Q5T871	98 aa		12	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	IGLC6	P0CF74	106 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	GZMB	P10144	247 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	TOR2A	Q5JU69	321 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	RAB4B	P61018	213 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	NFE4	Q86UQ8	179 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	OCC1	Q8TAD7	63 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	FAM210A	Q96ND0	272 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	AP1S3	Q96PC3	154 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	TPPP3	Q9BW30	176 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256		Q9UF83	564 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256		F2Z2F3	143 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	SMIM17	P0DL12	118 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	CACNG7	P62955	275 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF56	Q15929	161 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	NUDT11	Q96G61	164 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ATG13-223	ENST00000577256	PKD1	P98161	4303 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256		A0A087WWC5	75 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256		K7EN84	100 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	SST	P61278	116 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	CEBPG	P53567	150 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	PKHD1	P08F94	4074 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256		F5H697	171 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	TEX261	Q6UWH6	196 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	CTRL	P40313	264 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	UBE2D3	P61077	147 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	UBE2D2	P62837	147 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	WDR73	Q6P4I2	378 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	IGHV3-30	P01768	117 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	IGHV3-33	P01772	117 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	TRGC1	P0CF51	173 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG13-223	ENST00000577256	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF727	A8MUV8	499 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG13-223	ENST00000577256	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG13-223	ENST00000577256	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
ATG13-223	ENST00000577256	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
ATG13-223	ENST00000577256	CNFN	Q9BYD5	112 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG13-223	ENST00000577256		H7C1H1	209 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATG13-223	ENST00000577256	MGP	P08493	103 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATG13-223	ENST00000577256	NTF3	P20783	257 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATG13-223	ENST00000577256	ERVFC1-1	P60608	527 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATG13-223	ENST00000577256		A8MWL6	223 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-223	ENST00000577256	C16orf90	A8MZG2	172 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-223	ENST00000577256	EREG	O14944	169 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-223	ENST00000577256	LAGE3	Q14657	143 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-223	ENST00000577256	CT83	Q5H943	113 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATG13-223	ENST00000577256	LINC01551	Q86U37	167 aa		11.87	□□□□□ -0.51

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