RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 TYMSP04818 313 aa9.93□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 CXCL1P09341 107 aa9.93□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 ERVFC1-1P60608 527 aa9.93□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF575Q86XF7 245 aa9.93□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 PSG8Q9UQ74 426 aa9.93□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 ZFP30Q9Y2G7 519 aa9.93□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.92□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.92□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.92□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 SIVA1O15304 175 aa9.92□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 NXPH4O95158 308 aa9.92□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 MGST1P10620 155 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
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CMTM3-215ENST00000568477 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.92□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 Q86TA4 180 aa9.92□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.92□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 IL36BQ9NZH7 164 aa9.92□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 V9GYV3 84 aa9.92□□□□□ -0.82
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CMTM3-215ENST00000568477 SRIP30626 198 aa9.91□□□□□ -0.82
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CMTM3-215ENST00000568477 SMUG1Q53HV7 270 aa9.91□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 PRNTQ86SH4 94 aa9.91□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 K7EQD1 137 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 GYPEP15421 78 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.9□□□□□ -0.82
CMTM3-215ENST00000568477 C16orf90A8MZG2 172 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM3-215ENST00000568477 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
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CMTM3-215ENST00000568477 NHLRC2Q8NBF2 726 aa9.89□□□□□ -0.83
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CMTM3-215ENST00000568477 NUDT11Q96G61 164 aa9.89□□□□□ -0.83
CMTM3-215ENST00000568477 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00315P59091 139 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM3-215ENST00000568477 RPL19P84098 196 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF876PQ49A33 203 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM3-215ENST00000568477 CT83Q5H943 113 aa9.88□□□□□ -0.83
CMTM3-215ENST00000568477 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.87□□□□□ -0.83
CMTM3-215ENST00000568477 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.87□□□□□ -0.83
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CMTM3-215ENST00000568477 PRR27Q6MZM9 219 aa9.86□□□□□ -0.83
CMTM3-215ENST00000568477 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.86□□□□□ -0.83
CMTM3-215ENST00000568477 C9orf85Q96MD7 179 aa9.86□□□□□ -0.83
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CMTM3-215ENST00000568477 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa9.85□□□□□ -0.83
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CMTM3-215ENST00000568477 P01737 135 aa9.85□□□□□ -0.83
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CMTM3-215ENST00000568477 A8MWL6 223 aa9.84□□□□□ -0.83
CMTM3-215ENST00000568477 TRGC2P03986 189 aa9.84□□□□□ -0.83
CMTM3-215ENST00000568477 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.84□□□□□ -0.83
CMTM3-215ENST00000568477 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.84□□□□□ -0.83
CMTM3-215ENST00000568477 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa9.84□□□□□ -0.83
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa9.84□□□□□ -0.83
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CMTM3-215ENST00000568477 S100A4P26447 101 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 TIRAPP58753 221 aa9.83□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 RHOHQ15669 191 aa9.83□□□□□ -0.84
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CMTM3-215ENST00000568477 NFE4Q86UQ8 179 aa9.83□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 ZFP82Q8N141 532 aa9.83□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 PRADC1Q9BSG0 188 aa9.83□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.83□□□□□ -0.84
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CMTM3-215ENST00000568477 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.82□□□□□ -0.84
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CMTM3-215ENST00000568477 K7EP13 123 aa9.82□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 PHOX2AO14813 284 aa9.82□□□□□ -0.84
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CMTM3-215ENST00000568477 ASIPP42127 132 aa9.82□□□□□ -0.84
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CMTM3-215ENST00000568477 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.82□□□□□ -0.84
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CMTM3-215ENST00000568477 CRIP1P50238 77 aa9.81□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.81□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 WDR73Q6P4I2 378 aa9.81□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 PCLOQ9Y6V0 5065 aa9.8□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 EREGO14944 169 aa9.8□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 CDK2AP2O75956 126 aa9.8□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 S100A6P06703 90 aa9.8□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP10-2P60368 255 aa9.8□□□□□ -0.84
CMTM3-215ENST00000568477 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.8□□□□□ -0.84
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